$\begin{cases}\mathrm{pH\_calc} & \text{if $(\mathrm{time\_}\le 1)\lor ((\mathrm{time\_}> 1)\land (\mathrm{addbuffer}=0))$}\\ \mathrm{pHstat} & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{Par\_97}$ $\mathrm{Par\_98}$ $\mathrm{Par\_94}$ $\mathrm{Par\_90}$ $5E-2$ $2E-3$ $1.7E-3$ $4E-3$ $2E-3$ $4.7E-3$ $1.5E-4$ $2.7E-3$ $1.01E-2$ $2E-4$ $4.6E-3$ $1.5E-2$ $1.5E-3$ $7.4E-3$ $4.4E-3$ $0.00266054976219$ $2E-2$ $1.7505240494613$ $4.8E-1$ $6.3E-5$ $3E-5$ $8.8E-1$ $4.8E-4$ $1.19E-4$ $5.6E-2$ $1.8E-4$ $2E-2$ $8E-5$ $2.5E-4$ $4.02E-3$ $4.02E-3$ $2.7E-3$ $2.7E-3$ $8.7E-4$ $6E-5$ $1E-2$ $1E-2$ $13$ $0.01065914307349$ $5E-5$ $2E-3$ $1E-3$ $12$ $3.2E-4$ $6.1E-4$ $8.25E-2$ $1.8E-4$ $1.2E-5$ $2.2E-4$ $8E-6$ $1.265E0$ $2.5E-6$ $9E-5$ $2.9E-4$ $8E-7$ $3.3E-6$ $1.12E0$ $2E-3$ $8E-6$ $1.2E-3$ $3.5E-4$ $1.12E0$ $2E-4$ $1.4E-5$ $1.92E-1$ $1E-4$ $3.7E-4$ $1.44E0$ $8E-5$ $3E-4$ $7.05E-3$ $1.13E-3$ $1.92E0$ $3.35E-4$ $2E-6$ $1.7E-2$ $8.49E-4$ $5E-1$ $1.11E-3$ $3.5E-3$ $1.35E-4$ $3.9E-3$ $3.8E-3$ $8.8E-1$ $3.2E-4$ $2.7E-4$ $3.5E-4$ $0$ $1E-4$ $1E-1$ $1.5E-2$ $2.5E-2$ $1E-2$ $303.15$ $0.005$ $0.08$ $1$ $7.4$ $1$ $29$ $\mathrm{Par\_95}$ $\mathrm{Par\_96}$ $1$ $1.4775$ $1.6$ $\frac{\mathrm{RT2dadT}\sqrt{I}}{1+B\sqrt{I}}$ $0.1$ $1.17582$ $\frac{1\mathrm{alphadebye}(\frac{\sqrt{\mathrm{I1}}}{1+B\sqrt{\mathrm{I1}}}-\frac{\sqrt{I}}{1+B\sqrt{I}})}{\ln 10}$ $\frac{\frac{1}{T}-\frac{1}{\mathrm{T1}}}{\ln 10R}$ $2.91482$ $\frac{\mathrm{RTalpha}\sqrt{I}}{1+B\sqrt{I}}$ $0.5$ $3$ $-2.9$ $\mathrm{deltaH1o\_Pi}+\mathrm{Icorr}(2^2+1^2-1^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_Pi}+\mathrm{Icorr}(2^2+2^2-0^2)$ $6.75+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_Pi}$ $1.65+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_Pi}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_Pi})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_Pi}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_Pi}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_Pi}}$ $10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_Pi})}\mathrm{HPi2}$ $\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_Pi}}\mathrm{HPi2}$ $\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_Pi}}\mathrm{HPi2}$ $1\mathrm{H2Pi1}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_Pi}}(\mathrm{P\_Pi}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_Pi})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_Pi}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_Pi}+\mathrm{pKamg\_Pi})}}{\mathrm{P\_Pi}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_Pi}10^{\mathrm{pKamg\_Pi}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_Pi})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_Pi}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_Pi}+\mathrm{pKamg\_Pi})}\ln 10}{\mathrm{P\_Pi}^2}$ $1$ $-1096.1$ $\mathrm{deltaGof\_HPi2}+\mathrm{NH\_HPi2}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_HPi2})$ $-5$ $-18$ $-1$ $\mathrm{deltaH1o\_ATP}+\mathrm{Icorr}(4^2+1^2-3^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_ATP}+\mathrm{Icorr}(4^2+2^2-2^2)$ $\mathrm{deltaHko\_ATP}+\mathrm{Icorr}(4^2+1^2-3^2)$ $6.48+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(4^2+1^2-3^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_ATP}$ $4.19+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(4^2+2^2-2^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_ATP}$ $1.17+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(4^2+1^2-3^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHk\_ATP}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ATP})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_ATP}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_ATP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_ATP}}$ $10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ATP})}\mathrm{ATP4}$ $\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_ATP}}\mathrm{ATP4}$ $\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_ATP}}\mathrm{ATP4}$ $0\mathrm{ATP4}+1\mathrm{HATP3}+0\mathrm{mgATP2}+0\mathrm{kATP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_ATP}}(\mathrm{P\_ATP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ATP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_ATP}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_ATP}+\mathrm{pKamg\_ATP})}}{\mathrm{P\_ATP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_ATP}10^{\mathrm{pKamg\_ATP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_ATP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_ATP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ATP}+\mathrm{pKamg\_ATP})}\ln 10}{\mathrm{P\_ATP}^2}$ $12$ $-2768.1$ $\mathrm{deltaGof\_ATP4}+\mathrm{NH\_ATP4}RT\ln 10\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(16-\mathrm{NH\_ATP4})$ $1$ $-3$ $-15$ $\mathrm{deltaH1o\_ADP}+\mathrm{Icorr}(3^2+1^2-2^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_ADP}+\mathrm{Icorr}(3^2+2^2-1^2)$ $6.38+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(3^2+1^2-2^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_ADP}$ $3.25+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(3^2+2^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_ADP}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ADP})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_ADP}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_ADP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_ADP}}$ $10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ADP})}\mathrm{ADP3}$ $\frac{\mathrm{ADP3}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_ADP}}$ $\frac{\mathrm{ADP3}k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_ADP}}$ $0\mathrm{ADP3}+1\mathrm{HADP2}+0\mathrm{mgADP}+0\mathrm{kADP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_ADP}}(\mathrm{P\_ADP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ADP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_ADP}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_ADP}+\mathrm{pKamg\_ADP})}}{\mathrm{P\_ADP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_ADP}10^{\mathrm{pKamg\_ADP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_ADP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_ADP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_ADP}+\mathrm{pKamg\_ADP})}\ln 10}{\mathrm{P\_ADP}^2}$ $12$ $-1906.13$ $\mathrm{deltaGof\_ADP3}+\mathrm{NH\_ADP3}RT\ln 10\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(9-\mathrm{NH\_ADP3})$ $-3$ $-7.5$ $\mathrm{deltaH1o\_AMP}+\mathrm{Icorr}(2^2+1^2-1^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_AMP}+\mathrm{Icorr}(2^2+2^2-0^2)$ $6.29+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_AMP}$ $1.92+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+2^2-0^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_AMP}$ $1+10^{(\mathrm{pKa1\_AMP}-\mathrm{pH\_cy})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_AMP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_AMP}}$ $\mathrm{AMP2}10^{(\mathrm{pKa1\_AMP}-\mathrm{pH\_cy})}$ $\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_AMP}}\mathrm{AMP2}$ $0\mathrm{AMP2}+\mathrm{HAMP1}+0\mathrm{mgAMP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_AMP}}(\mathrm{P\_AMP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_AMP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_AMP}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_AMP}+\mathrm{pKamg\_AMP})}}{\mathrm{P\_AMP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_AMP}10^{\mathrm{pKamg\_AMP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_AMP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_AMP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_AMP}+\mathrm{pKamg\_AMP})}\ln 10}{\mathrm{P\_AMP}^2}$ $12$ $-1040.45$ $\mathrm{deltaGof\_AMP2}+\mathrm{NH\_AMP2}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_AMP2})$ $0.31$ $2.66$ $8.19$ $\mathrm{deltaH1o\_PCR}+\mathrm{Icorr}(2^2+1^2-1^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_PCR}+\mathrm{Icorr}(2^2+2^2-0^2)$ $4.5+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_PCR}$ $1.6+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+2^2-0^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_PCR}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PCR})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_PCR}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_PCR}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_PCR}}$ $10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PCR})}\mathrm{HPCR}$ $\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_PCR}}\mathrm{HPCR}$ $\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_PCR}}\mathrm{HPCR}$ $\mathrm{H2PCR}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_PCR}}(\mathrm{P\_PCR}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PCR})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_PCR}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_PCR}+\mathrm{pKamg\_PCR})}}{\mathrm{P\_PCR}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_PCR}10^{\mathrm{pKamg\_PCR}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_PCR})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_PCR}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PCR}+\mathrm{pKamg\_PCR})}\ln 10}{\mathrm{P\_PCR}^2}$ $8$ $2.3$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_CR})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_CR}}$ $\mathrm{HCR}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_CR})}$ $0\mathrm{HCR}+1\mathrm{H2CR}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_CR}}(\mathrm{P\_CR}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_CR})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_CR}^2}$ $0$ $9$ $-1.7$ $-12$ $\mathrm{deltaH1o\_G1P}+\mathrm{Icorr}(2^2+1^2-1^2)$ $\mathrm{deltaHmgo\_G1P}+\mathrm{Icorr}(2^2+2^2-0^2)$ $6.09+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_G1P}$ $2.48+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+2^2-0^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaHmg\_G1P}$ $1+10^{-\mathrm{pH\_cy}}10^{\mathrm{pKa1\_G1P}}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_G1P}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_G1P}}$ $\mathrm{UG1P}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G1P})}$ $\frac{\mathrm{UG1P}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_G1P}}$ $\mathrm{HG1P}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_G1P}}(\mathrm{P\_G1P}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G1P})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_G1P}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_G1P}+\mathrm{pKamg\_G1P})}}{\mathrm{P\_G1P}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_G1P}10^{\mathrm{pKamg\_G1P}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_G1P})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_G1P}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G1P}+\mathrm{pKamg\_G1P})}\ln 10}{\mathrm{P\_G1P}^2}$ $11$ $-1756.87$ $\mathrm{deltaGof\_UG1P}+\mathrm{NH\_UG1P}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UG1P})$ $6.11$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G6P})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_G6P}}$ $\mathrm{UG6P}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G6P})}$ $\mathrm{HG6P}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_G6P}}(\mathrm{P\_G6P}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G6P})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_G6P}^2}$ $0$ $11$ $-1763.94$ $\mathrm{deltaGof\_UG6P}+\mathrm{NH\_UG6P}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UG6P})$ $5.89$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_F6P})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_F6P}}$ $\mathrm{UF6P}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_F6P})}$ $\mathrm{HF6P}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_F6P}}(\mathrm{P\_F6P}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_F6P})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_F6P}^2}$ $0$ $11$ $-1760.8$ $\mathrm{deltaGof\_UF6P}+\mathrm{NH\_UF6P}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UF6P})$ $6.4$ $5.92$ $2.7$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP})}+10^{(2\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_FDP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_FDP}}$ $\mathrm{UFDP}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP})}$ $\mathrm{UFDP}10^{(2\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})}$ $\frac{\mathrm{UFDP}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_FDP}}$ $\mathrm{HFDP}+2\mathrm{H2FDP}$ $\frac{\mathrm{P\_FDP}(10^{\mathrm{pKa1\_FDP}}+210^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})})-(10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP})}+210^{(2\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})})(10^{\mathrm{pKa1\_FDP}}+210^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_FDP}^2}$ $\frac{-(10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP})}+210^{(2\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})})10^{\mathrm{pKamg\_FDP}}}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_FDP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_FDP}10^{\mathrm{pKamg\_FDP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_FDP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_FDP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_FDP}}(\mathrm{P\_FDP}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP})}\ln 10-10^{(2\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_FDP}+\mathrm{pKa2\_FDP})}\times 2\ln 10)}{\mathrm{P\_FDP}^2}$ $10$ $-2601.4$ $\mathrm{deltaGof\_UFDP}+\mathrm{NH\_UFDP}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(16-\mathrm{NH\_UFDP})$ $6.45$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_GAP})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_GAP}}$ $\mathrm{UGAP}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_GAP})}$ $\mathrm{HGAP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_GAP}}(\mathrm{P\_GAP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_GAP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_GAP}^2}$ $0$ $5$ $-1288.6$ $\mathrm{deltaGof\_UGAP}+\mathrm{NH\_UGAP}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UGAP})$ $1.63$ $-3.1$ $\mathrm{deltaH1o\_G3P}+\mathrm{Icorr}(2^2+1^2-1^2)$ $6.22+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(2^2+1^2-1^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_G3P}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G3P})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_G3P}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_G3P}}$ $\mathrm{UG3P}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G3P})}$ $\frac{\mathrm{UG3P}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_G3P}}$ $\mathrm{HG3P}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_G3P}}(\mathrm{P\_G3P}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G3P})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_G3P}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_G3P}+\mathrm{pKamg\_G3P})}}{\mathrm{P\_G3P}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_G3P}10^{\mathrm{pKamg\_G3P}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_G3P})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_G3P}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_G3P}+\mathrm{pKamg\_G3P})}\ln 10}{\mathrm{P\_G3P}^2}$ $7$ $-1339.25$ $\mathrm{deltaGof\_UG3P}+\mathrm{NH\_UG3P}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UG3P})$ $5.9$ $1.57$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_DHAP})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_DHAP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_DHAP}}$ $\mathrm{UDHAP}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_DHAP})}$ $\frac{\mathrm{UDHAP}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_DHAP}}$ $\mathrm{HDHAP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_DHAP}}(\mathrm{P\_DHAP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_DHAP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_DHAP}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_DHAP}+\mathrm{pKamg\_DHAP})}}{\mathrm{P\_DHAP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_DHAP}10^{\mathrm{pKamg\_DHAP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_DHAP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_DHAP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_DHAP}+\mathrm{pKamg\_DHAP})}\ln 10}{\mathrm{P\_DHAP}^2}$ $5$ $-1296.26$ $\mathrm{deltaGof\_UDHAP}+\mathrm{NH\_UDHAP}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_UDHAP})$ $7.5$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_13DPG})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_13DPG}}$ $\mathrm{U13DPG}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_13DPG})}$ $\mathrm{H13DPG}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_13DPG}}(\mathrm{P\_13DPG}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_13DPG})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_13DPG}^2}$ $0$ $4$ $-2356.14$ $\mathrm{deltaGof\_U13DPG}+\mathrm{NH\_U13DPG}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(16-\mathrm{NH\_U13DPG})$ $6.21$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+6.21)}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_3PG}}$ $\mathrm{U3PG}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+6.21)}$ $\mathrm{H3PG}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_3PG}}(\mathrm{P\_3PG}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_3PG})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_3PG}^2}$ $0$ $4$ $-1502.54$ $\mathrm{deltaGof\_U3PG}+\mathrm{NH\_U3PG}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(9-\mathrm{NH\_U3PG})$ $7$ $2.45$ $1.18$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_2PG})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_2PG}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_2PG}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_2PG}}$ $\mathrm{U2PG}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_2PG})}$ $\frac{\mathrm{U2PG}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_2PG}}$ $\frac{\mathrm{U2PG}k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_2PG}}$ $\mathrm{H2PG}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_2PG}}(\mathrm{P\_2PG}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_2PG})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_2PG}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_2PG}+\mathrm{pKamg\_2PG})}}{\mathrm{P\_2PG}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_2PG}10^{\mathrm{pKamg\_2PG}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_2PG})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_2PG}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_2PG}+\mathrm{pKamg\_2PG})}\ln 10}{\mathrm{P\_2PG}^2}$ $4$ $-1496.38$ $\mathrm{deltaGof\_U2PG}+\mathrm{NH\_U2PG}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(9-\mathrm{NH\_U2PG})$ $6.35$ $2.26$ $1.08$ $1+10^{(\mathrm{pKa1\_PEP}-\mathrm{pH\_cy})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_PEP}}+\frac{k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_PEP}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_PEP}}$ $\mathrm{UPEP}10^{(\mathrm{pKa1\_PEP}-\mathrm{pH\_cy})}$ $\frac{\mathrm{UPEP}k}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKak\_PEP}}$ $\frac{\mathrm{UPEP}\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_PEP}}$ $\mathrm{HPEP}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_PEP}}(\mathrm{P\_PEP}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PEP})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_PEP}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_PEP}+\mathrm{pKamg\_PEP})}}{\mathrm{P\_PEP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_PEP}10^{\mathrm{pKamg\_PEP}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_PEP})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_PEP}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PEP}+\mathrm{pKamg\_PEP})}\ln 10}{\mathrm{P\_PEP}^2}$ $2$ $-1263.65$ $\mathrm{deltaGof\_UPEP}+\mathrm{NH\_UPEP}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(9-\mathrm{NH\_UPEP})$ $2.49$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PYR})}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_PYR}}$ $\mathrm{UPYR}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PYR})}$ $\mathrm{HPYR}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_PYR}}(\mathrm{P\_PYR}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_PYR})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_PYR}^2}$ $0$ $3$ $-472.27$ $\mathrm{deltaGof\_UPYR}+\mathrm{NH\_UPYR}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(1-\mathrm{NH\_UPYR})$ $0.98$ $-0.33$ $\mathrm{deltaH1o\_LAC}+\mathrm{Icorr}(1^2+1^2-0^2)$ $3.67+\frac{\mathrm{IcorrpKa}}{1}(1^2+1^2-0^2)+\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_LAC}$ $1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_LAC})}+\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_LAC}}$ $\frac{1}{\mathrm{P\_LAC}}$ $\mathrm{ULAC}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_LAC})}$ $\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{\mathrm{pKamg\_LAC}}\mathrm{ULAC}$ $\mathrm{HLAC}$ $\frac{10^{\mathrm{pKa1\_LAC}}(\mathrm{P\_LAC}-10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_LAC})})}{\mathrm{c0}\mathrm{P\_LAC}^2}$ $\frac{\frac{-10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{c0}}10^{(\mathrm{pKa1\_LAC}+\mathrm{pKamg\_LAC})}}{\mathrm{P\_LAC}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{P\_LAC}10^{\mathrm{pKamg\_LAC}}}{\mathrm{c0}}-\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(2\mathrm{pKamg\_LAC})}}{\mathrm{c0}}}{\mathrm{P\_LAC}^2}$ $\frac{\frac{\mathrm{mg}}{\mathrm{c0}}10^{(-\mathrm{pH\_cy}+\mathrm{pKa1\_LAC}+\mathrm{pKamg\_LAC})}\ln 10}{\mathrm{P\_LAC}^2}$ $5$ $-516.72$ $\mathrm{deltaGof\_ULAC}+\mathrm{NH\_ULAC}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(1-\mathrm{NH\_ULAC})$ $-10$ $655.7+\mathrm{dNH\_GLY}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}$ $26$ $0$ $\mathrm{deltaGof\_NAD}+\mathrm{NH\_NAD}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(1-\mathrm{NH\_NAD})$ $27$ $22.65$ $\mathrm{deltaGof\_NADH}+\mathrm{NH\_NADH}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(4-\mathrm{NH\_NADH})$ $2$ $-237.19$ $\mathrm{deltaGof\_H2O}+\mathrm{NH\_H2O}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}-\mathrm{IcorrdeltaGpof}(0-\mathrm{NH\_H2O})$ $1$ $0$ $\mathrm{deltaGof\_H}+\mathrm{NH\_H}\ln 10RT\mathrm{pH\_cy}$ $\mathrm{Navg\_ATP}+\mathrm{Navg\_CR}-\mathrm{Navg\_PCR}-\mathrm{Navg\_ADP}+\mathrm{NH\_ATP4}+\mathrm{NH\_HCR}-\mathrm{NH\_HPCR}-\mathrm{NH\_ADP3}$ $2.58E8$ $-17.55$ $\mathrm{deltaHo\_CKo}+\mathrm{Icorr}(2^2+3^2+1^2-4^2-0^2)$ $e^{\ln \mathrm{Kref\_CK}+\frac{\mathrm{alphadebye}\sqrt{I}(2^2+3^2+1^2-4^2-0^2)}{1+B\sqrt{I}}}$ $10^{(\ln \mathrm{Kref\_CKI}-\mathrm{TcorrpKa}\mathrm{deltaH1\_CK})}$ $-RT\ln \mathrm{Kref\_CKT}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_CK}}{RT}}10^{-\mathrm{pH\_cy}}\mathrm{P\_ATP}\mathrm{P\_CR}}{\mathrm{P\_PCR}\mathrm{P\_ADP}}$ $2\mathrm{Navg\_ADP}-\mathrm{Navg\_ATP}-\mathrm{Navg\_AMP}+2\mathrm{NH\_ADP3}-\mathrm{NH\_ATP4}-\mathrm{NH\_AMP2}$ $2\mathrm{deltaGpof\_ADP3}-\mathrm{deltaGpof\_ATP4}-\mathrm{deltaGpof\_AMP2}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_ADK}}{RT}}\mathrm{P\_ADP}^2}{\mathrm{P\_ATP}\mathrm{P\_AMP}}$ $\mathrm{Navg\_G1P}-\mathrm{Navg\_Pi}+1-\mathrm{NH\_HPi2}$ $\mathrm{deltaGpo\_GLY}+\mathrm{deltaGpof\_UG1P}-\mathrm{deltaGpof\_HPi2}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_GP}}{RT}}\mathrm{P\_G1P}}{\mathrm{P\_Pi}}$ $\mathrm{Navg\_G6P}-\mathrm{Navg\_G1P}+\mathrm{NH\_UG6P}-\mathrm{NH\_UG1P}$ $\mathrm{deltaGpof\_UG6P}-\mathrm{deltaGpof\_UG1P}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PGLM}}{RT}}\mathrm{P\_G6P}}{\mathrm{P\_G1P}}$ $\mathrm{Navg\_F6P}-\mathrm{Navg\_G6P}+\mathrm{NH\_UF6P}-\mathrm{NH\_UG6P}$ $\mathrm{deltaGpof\_UF6P}-\mathrm{deltaGpof\_UG6P}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PGI}}{RT}}\mathrm{P\_F6P}}{\mathrm{P\_G6P}}$ $\mathrm{Navg\_ADP}+\mathrm{Navg\_FDP}-\mathrm{Navg\_F6P}-\mathrm{Navg\_ATP}+\mathrm{NH\_ADP3}+\mathrm{NH\_UFDP}-\mathrm{NH\_UF6P}-\mathrm{NH\_ATP4}$ $\mathrm{deltaGpof\_UFDP}+\mathrm{deltaGpof\_ADP3}+\mathrm{deltaGpof\_H}-\mathrm{deltaGpof\_UF6P}-\mathrm{deltaGpof\_ATP4}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PFK}}{RT}}\mathrm{P\_FDP}\mathrm{P\_ADP}}{\mathrm{P\_F6P}\mathrm{P\_ATP}10^{-\mathrm{pH\_cy}}}$ $\mathrm{Navg\_DHAP}+\mathrm{Navg\_GAP}-\mathrm{Navg\_FDP}+\mathrm{NH\_UDHAP}+\mathrm{NH\_UGAP}-\mathrm{NH\_UFDP}$ $\mathrm{deltaGpof\_UDHAP}+\mathrm{deltaGpof\_UGAP}-\mathrm{deltaGpof\_UFDP}$ $\frac{1e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_ALD}}{RT}}\mathrm{P\_GAP}\mathrm{P\_FDP}}{\mathrm{P\_DHAP}}$ $\mathrm{Navg\_DHAP}-\mathrm{Navg\_GAP}+\mathrm{NH\_UDHAP}-\mathrm{NH\_UGAP}$ $\mathrm{deltaGpof\_UDHAP}-\mathrm{deltaGpof\_UGAP}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_TPI}}{RT}}\mathrm{P\_DHAP}}{\mathrm{P\_GAP}}$ $\mathrm{Navg\_13DPG}-\mathrm{Navg\_GAP}-\mathrm{Navg\_Pi}+\mathrm{NH\_U13DPG}+\mathrm{NH\_NADH}-\mathrm{NH\_UGAP}-\mathrm{NH\_HPi2}-\mathrm{NH\_NAD}$ $\mathrm{deltaGpof\_U13DPG}+\mathrm{deltaGpof\_NADH}+\mathrm{deltaGpof\_H}-\mathrm{deltaGpof\_HPi2}-\mathrm{deltaGpof\_UGAP}-\mathrm{deltaGpof\_NAD}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_GAPDH}}{RT}}\mathrm{P\_13DPG}}{\mathrm{P\_Pi}\mathrm{P\_GAP}10^{-\mathrm{pH\_cy}}\times 1}$ $\mathrm{Navg\_DHAP}-\mathrm{Navg\_G3P}+\mathrm{NH\_UDHAP}+\mathrm{NH\_NADH}-\mathrm{NH\_NAD}-\mathrm{NH\_UG3P}$ $\mathrm{deltaGpof\_H}+\mathrm{deltaGpof\_NADH}+\mathrm{deltaGpof\_UDHAP}-\mathrm{deltaGpof\_NAD}-\mathrm{deltaGpof\_UG3P}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_G3PDH}}{RT}}\mathrm{P\_DHAP}}{\mathrm{P\_G3P}10^{-\mathrm{pH\_cy}}}$ $\mathrm{Navg\_3PG}+\mathrm{Navg\_ATP}-\mathrm{Navg\_13DPG}-\mathrm{Navg\_ADP}+\mathrm{NH\_U3PG}+\mathrm{NH\_ATP4}-\mathrm{NH\_U13DPG}-\mathrm{NH\_ADP3}$ $\mathrm{deltaGpof\_ATP4}+\mathrm{deltaGpof\_U3PG}-\mathrm{deltaGpof\_U13DPG}-\mathrm{deltaGpof\_ADP3}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PGK}}{RT}}\mathrm{P\_ATP}\mathrm{P\_3PG}}{\mathrm{P\_13DPG}\mathrm{P\_ADP}}$ $\mathrm{Navg\_2PG}-\mathrm{Navg\_3PG}+\mathrm{NH\_U2PG}-\mathrm{NH\_U3PG}$ $\mathrm{deltaGpof\_U2PG}-\mathrm{deltaGpof\_U3PG}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PGM}}{RT}}\mathrm{P\_2PG}}{\mathrm{P\_3PG}}$ $\mathrm{Navg\_PEP}-\mathrm{Navg\_2PG}+\mathrm{NH\_H2O}+\mathrm{NH\_UPEP}-\mathrm{NH\_U2PG}$ $\mathrm{deltaGpof\_H2O}+\mathrm{deltaGpof\_UPEP}-\mathrm{deltaGpof\_U2PG}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_ENOL}}{RT}}\mathrm{P\_PEP}}{\mathrm{P\_2PG}}$ $\mathrm{Navg\_PYR}+\mathrm{Navg\_ATP}-\mathrm{Navg\_PEP}-\mathrm{Navg\_ADP}+\mathrm{NH\_UPYR}+\mathrm{NH\_ATP4}-\mathrm{NH\_UPEP}-\mathrm{NH\_ADP3}$ $\mathrm{deltaGpof\_UPYR}+\mathrm{deltaGpof\_ATP4}-\mathrm{deltaGpof\_H}-\mathrm{deltaGpof\_UPEP}-\mathrm{deltaGpof\_ADP3}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_PK}}{RT}}\mathrm{P\_PYR}\mathrm{P\_ATP}10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{P\_PEP}\mathrm{P\_ADP}}$ $\mathrm{Navg\_LAC}-\mathrm{Navg\_PYR}+\mathrm{NH\_ULAC}+\mathrm{NH\_NAD}-\mathrm{NH\_UPYR}-\mathrm{NH\_NADH}$ $\mathrm{deltaGpof\_ULAC}+\mathrm{deltaGpof\_NAD}-\mathrm{deltaGpof\_UPYR}-\mathrm{deltaGpof\_NADH}-\mathrm{deltaGpof\_H}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_LDH}}{RT}}\mathrm{P\_LAC}10^{-\mathrm{pH\_cy}}}{\mathrm{P\_PYR}}$ $\mathrm{Navg\_ADP}+\mathrm{Navg\_Pi}-\mathrm{Navg\_ATP}+\mathrm{NH\_ADP3}+\mathrm{NH\_HPi2}-\mathrm{NH\_ATP4}-\mathrm{NH\_H2O}$ $\mathrm{deltaGpof\_ADP3}+\mathrm{deltaGpof\_HPi2}+\mathrm{deltaGpof\_H}-\mathrm{deltaGpof\_H2O}-\mathrm{deltaGpof\_ATP4}$ $\frac{e^{\frac{-\mathrm{deltaGpo\_ATPase}}{RT}}\mathrm{P\_ADP}\mathrm{P\_Pi}}{\mathrm{P\_ATP}10^{-\mathrm{pH\_cy}}}$ $\mathrm{Par\_1}$ $\mathrm{Par\_100}$ $\begin{cases}\mathrm{Par\_2} & \text{if $\mathrm{expno}\neq 45$}\\ 0.001 & \text{if $\mathrm{time\_}< 40$}\\ 0.004 & \text{if $(\mathrm{time\_}\ge 40)\land (\mathrm{time\_}< 80)$}\\ 0.01 & \text{if $(\mathrm{time\_}\ge 80)\land (\mathrm{time\_}< 100)$}\\ 0.04 & \text{if $\mathrm{time\_}\ge 100$}\end{cases}$ $\mathrm{Par\_3}$ $\mathrm{Par\_4}$ $\mathrm{Par\_5}$ $\mathrm{Par\_6}$ $\mathrm{Par\_7}$ $\mathrm{Par\_8}$ $\mathrm{Par\_9}$ $1+\frac{\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpA\_glyf}}+\frac{\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpA\_pi}}+\frac{\mathrm{Gly}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpA\_glyf}\mathrm{KgpA\_ipi}}+\frac{\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpA\_glyb}}+\frac{\mathrm{G1P}}{\mathrm{KgpA\_g1p}}+\frac{\mathrm{Gly}\mathrm{G1P}}{\mathrm{KgpA\_ig1p}\mathrm{KgpA\_glyb}}$ $\frac{1.404}{1+10^{(5.94-\mathrm{pH\_cy})}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-7.29)}}$ $\frac{\mathrm{pa}\mathrm{Vfgly}\mathrm{KgpA\_glyb}\mathrm{KgpA\_ig1p}}{\mathrm{KgpA\_igly}\mathrm{KgpA\_pi}\mathrm{Kapp\_GP}}$ $\frac{\frac{\mathrm{pa}\mathrm{Vfgly}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpA\_igly}\mathrm{KgpA\_pi}}}{\mathrm{Dglya}}$ $\frac{\frac{\mathrm{VbglyA}\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpA\_glyb}\mathrm{KgpA\_ig1p}}}{\mathrm{Dglya}}$ $\mathrm{fracA}(\mathrm{Gly}\mathrm{glyAF}-\mathrm{G1P}\mathrm{glyAR})$ $1-\mathrm{fracA}$ $\mathrm{Par\_10}$ $\mathrm{Par\_11}$ $\mathrm{Par\_12}$ $\mathrm{Par\_13}$ $\mathrm{Par\_14}$ $\mathrm{Par\_15}$ $\mathrm{Par\_16}$ $\mathrm{Par\_17}$ $\mathrm{Par\_18}$ $\frac{\frac{\left(\frac{\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kgp\_amp}}\right)^{\mathrm{nH}}}{\mathrm{interactioncoeff}}}{1+\frac{\left(\frac{\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kgp\_amp}}\right)^{\mathrm{nH}}}{\mathrm{interactioncoeff}}}$ $1+\frac{\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpB\_iglyf}}+\frac{\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpB\_ipi}}+\frac{\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpB\_iglyb}}+\frac{\mathrm{G1P}}{\mathrm{KgpB\_ig1p}}+\frac{\mathrm{Gly}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpB\_iglyf}\mathrm{KgpB\_pi}}+\frac{\mathrm{Gly}\mathrm{G1P}}{\mathrm{KgpB\_g1p}\mathrm{KgpB\_iglyb}}$ $\frac{1.75}{1+10^{(6.12-\mathrm{pH\_cy})}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-7.03)}}$ $\frac{\mathrm{pb}\mathrm{Vfgly}\mathrm{KgpB\_g1p}\mathrm{KgpB\_iglyb}}{\mathrm{KgpB\_iglyf}\mathrm{KgpB\_pi}\mathrm{Kapp\_GP}}$ $\frac{\frac{\mathrm{pb}M\mathrm{Vfgly}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{KgpB\_iglyf}\mathrm{KgpB\_pi}}}{\mathrm{Dglyb}}$ $\frac{\frac{M\mathrm{VbglyB}\mathrm{Gly}}{\mathrm{KgpB\_g1p}\mathrm{KgpB\_iglyb}}}{\mathrm{Dglyb}}$ $\mathrm{fracB}(\mathrm{Gly}\mathrm{glyBF}-\mathrm{G1P}\mathrm{glyBR})$ $\mathrm{Par\_19}$ $\mathrm{Par\_20}$ $\mathrm{Par\_21}$ $\frac{\mathrm{Vffpglm}\times 1.329}{1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+6.64)}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-8.36)}}$ $\frac{\mathrm{Vfpglm}\mathrm{Kpglm\_g6p}}{\mathrm{Kpglm\_g1p}\mathrm{Kapp\_PGLM}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfpglm}\mathrm{G1P}}{\mathrm{Kpglm\_g1p}}-\frac{\mathrm{Vbpglm}\mathrm{G6P}}{\mathrm{Kpglm\_g6p}}}{1+\frac{\mathrm{G1P}}{\mathrm{Kpglm\_g1p}}+\frac{\mathrm{G6P}}{\mathrm{Kpglm\_g6p}}}$ $\mathrm{Par\_22}$ $\mathrm{Par\_23}$ $\mathrm{Par\_24}$ $\frac{\mathrm{Vbbpgi}}{1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+6.94)}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-9.35)}}$ $\frac{\mathrm{Vbpgi}\mathrm{Kpgi\_g6p}}{\mathrm{Kpgi\_f6p}}\mathrm{Kapp\_PGI}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfpgi}\mathrm{G6P}}{\mathrm{Kpgi\_g6p}}-\frac{\mathrm{Vbpgi}\mathrm{F6P}}{\mathrm{Kpgi\_f6p}}}{1+\frac{\mathrm{F6P}}{\mathrm{Kpgi\_f6p}}+\frac{\mathrm{G6P}}{\mathrm{Kpgi\_g6p}}}$ $\mathrm{Par\_25}$ $\mathrm{Par\_26}$ $\mathrm{Par\_27}$ $\mathrm{Par\_28}$ $\mathrm{Par\_29}$ $\mathrm{Par\_30}$ $\mathrm{Par\_31}$ $\mathrm{Par\_32}$ $\mathrm{Par\_33}$ $\mathrm{Par\_34}$ $\mathrm{Par\_35}$ $\mathrm{Par\_36}$ $\mathrm{Par\_37}$ $\mathrm{Par\_38}$ $\frac{\mathrm{Vffpfk}}{1+\left(\frac{\mathrm{pH\_cy}}{6.8}\right)^{-30}}$ $\frac{\mathrm{Vfpfk}\mathrm{Kpfk\_fbp}\mathrm{Kpfk\_adp}}{\mathrm{Kpfk\_f6p}\mathrm{Kpfk\_atp}\mathrm{Kapp\_PFK}}$ $\mathrm{Lo}\left(\frac{\frac{1+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpfki}}}{1+\frac{d\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpfki}}}(1+\frac{\mathrm{e\_}\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kmpfk}})}{1+\frac{\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kmpfk}}}\right)^4$ $\frac{\mathrm{Kpfk\_f6p}\mathrm{Kpfk\_atp}}{\mathrm{Kpfk\_f6pT}\mathrm{Kpfk\_atpT}}$ $(1+\frac{\mathrm{F6P}}{\mathrm{Kpfk\_f6p}})(1+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpfk\_atp}})+\frac{\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kpfk\_fbp}}+\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpfk\_adp}}(1+\frac{\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kpfk\_fbp}})$ $(1+\frac{\mathrm{F6P}}{\mathrm{Kpfk\_f6pT}})(1+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpfk\_atpT}})+\frac{\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kpfk\_fbpT}}+\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpfk\_adpT}}(1+\frac{\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kpfk\_fbpT}})$ $\frac{(\frac{\frac{\mathrm{Vfpfk}\mathrm{F6P}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpfk\_f6p}\mathrm{Kpfk\_atp}}}{\mathrm{Delta}}-\frac{\frac{\mathrm{Vbpfk}\mathrm{ADP}\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kpfk\_adp}\mathrm{Kpfk\_fbp}}}{\mathrm{Delta}})(1+\mathrm{alpha}L\left(\frac{\mathrm{Deltap}}{\mathrm{Delta}}\right)^3)}{1+L\left(\frac{\mathrm{Deltap}}{\mathrm{Delta}}\right)^4}$ $\mathrm{Par\_39}$ $\mathrm{Par\_40}$ $\mathrm{Par\_41}$ $\mathrm{Par\_42}$ $\frac{\mathrm{Vffald}\times 1.013}{1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+5.32)}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-9.15)}}$ $\frac{\mathrm{Vfald}\mathrm{Kald\_gap}\mathrm{Kald\_dhap}}{\mathrm{Kald\_fbp}\mathrm{Kapp\_ALD}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfald}\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kald\_fbp}}-\frac{\mathrm{Vbald}\mathrm{GAP}\mathrm{DHAP}}{\mathrm{Kald\_gap}\mathrm{Kald\_dhap}}}{1+\frac{\mathrm{FBP}}{\mathrm{Kald\_fbp}}+\frac{\mathrm{GAP}}{\mathrm{Kald\_gap}}+\frac{\mathrm{DHAP}}{\mathrm{Kald\_dhap}}}$ $\mathrm{Par\_43}$ $\mathrm{Par\_44}$ $\mathrm{Par\_45}$ $\mathrm{Vfftpi}$ $\frac{\mathrm{Vftpi}\mathrm{Ktpi\_dhap}}{\mathrm{Ktpi\_gap}\mathrm{Kapp\_TPI}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vftpi}\mathrm{GAP}}{\mathrm{Ktpi\_gap}}-\frac{\mathrm{Vbtpi}\mathrm{DHAP}}{\mathrm{Ktpi\_dhap}}}{1+\frac{\mathrm{GAP}}{\mathrm{Ktpi\_gap}}+\frac{\mathrm{DHAP}}{\mathrm{Ktpi\_dhap}}}$ $\mathrm{Par\_46}$ $\mathrm{Par\_47}$ $\mathrm{Par\_48}$ $\mathrm{Par\_49}$ $\mathrm{Par\_50}$ $(1+\frac{\mathrm{G3P}}{\mathrm{Kg3pdh\_g3p}}+\frac{\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kg3pdh\_nadh}})(1+\frac{\mathrm{DHAP}}{\mathrm{Kg3pdh\_dhap}}+\frac{\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kg3pdh\_nadh}})$ $\mathrm{Vbbg3pdh}$ $\frac{\mathrm{Vbg3pdh}\mathrm{Kg3pdh\_g3p}\mathrm{Kg3pdh\_nad}\mathrm{Kapp\_G3PDH}}{\mathrm{Kg3pdh\_dhap}\mathrm{Kg3pdh\_nadh}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfg3pdh}\mathrm{G3P}\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kg3pdh\_g3p}\mathrm{Kg3pdh\_nad}}-\frac{\mathrm{Vbg3pdh}\mathrm{DHAP}\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kg3pdh\_dhap}\mathrm{Kg3pdh\_nadh}}}{\mathrm{Dg3pdh}}$ $\mathrm{Par\_51}$ $\mathrm{Par\_52}$ $\mathrm{Par\_53}$ $\mathrm{Par\_54}$ $\mathrm{Par\_55}$ $\mathrm{Par\_56}$ $1+\frac{\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{Kgapdh\_pi}}+\frac{\mathrm{GAP}}{\mathrm{Kgapdh\_gap}}+\frac{\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kgapdh\_nad}}+\frac{\mathrm{GAP}\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kgapdh\_gap}\mathrm{Kgapdh\_nad}}+\frac{\mathrm{GAP}\mathrm{NAD}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{Kgapdh\_gap}\mathrm{Kgapdh\_nad}\mathrm{Kgapdh\_pi}}+\frac{\mathrm{BPG}}{\mathrm{Kgapdh\_bpg}}+\frac{\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kgapdh\_nadh}}+\frac{\mathrm{BPG}\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kgapdh\_nadh}\mathrm{Kgapdh\_bpg}}$ $\mathrm{Vffgad}\times 0.0007e^{\mathrm{pH\_cy}\times 0.8979}$ $\frac{\mathrm{Vfgad}\mathrm{Kgapdh\_bpg}\mathrm{Kgapdh\_nadh}}{\mathrm{Kgapdh\_gap}\mathrm{Kgapdh\_pi}\mathrm{Kgapdh\_nad}\mathrm{Kapp\_GAPDH}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfgad}\mathrm{GAP}\mathrm{NAD}\mathrm{Pi\_}}{\mathrm{Kgapdh\_nad}\mathrm{Kgapdh\_gap}\mathrm{Kgapdh\_pi}}-\frac{\mathrm{Vbgad}\mathrm{BPG}\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kgapdh\_bpg}\mathrm{Kgapdh\_nadh}}}{\mathrm{Dgap}}$ $\mathrm{Par\_57}$ $\mathrm{Par\_58}$ $\mathrm{Par\_59}$ $\mathrm{Par\_60}$ $\mathrm{Par\_61}$ $\mathrm{Vbbpgk}$ $\frac{\mathrm{Vbpgk}\mathrm{Kpgk\_bpg}\mathrm{Kpgk\_adp}}{\mathrm{Kpgk\_3pg}\mathrm{Kpgk\_atp}}\mathrm{Kapp\_PGK}$ $1+\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpgk\_adp}}+\frac{\mathrm{BPG}}{\mathrm{Kpgk\_bpg}}+\frac{\mathrm{BPG}\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpgk\_bpg}\mathrm{Kpgk\_adp}}+\frac{\mathrm{P3G}}{\mathrm{Kpgk\_3pg}}+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpgk\_atp}}+\frac{\mathrm{P3G}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpgk\_3pg}\mathrm{Kpgk\_atp}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfpgk}\mathrm{BPG}\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpgk\_adp}\mathrm{Kpgk\_bpg}}-\frac{\mathrm{Vbpgk}\mathrm{ATP}\mathrm{P3G}}{\mathrm{Kpgk\_atp}\mathrm{Kpgk\_3pg}}}{\mathrm{D\_PGK}}$ $\mathrm{Par\_62}$ $\mathrm{Par\_63}$ $\mathrm{Par\_64}$ $\frac{\mathrm{Vffpgm}\times 0.989}{1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+5.62)}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-8.74)}}$ $\frac{\mathrm{Vfpgm}\mathrm{Kpgm\_2pg}}{\mathrm{Kpgm\_3pg}\mathrm{Kapp\_PGM}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfpgm}\mathrm{P3G}}{\mathrm{Kpgm\_3pg}}-\frac{\mathrm{Vbpgm}\mathrm{P2G}}{\mathrm{Kpgm\_2pg}}}{1+\frac{\mathrm{P3G}}{\mathrm{Kpgm\_3pg}}+\frac{\mathrm{P2G}}{\mathrm{Kpgm\_2pg}}}$ $\mathrm{Par\_65}$ $\mathrm{Par\_66}$ $\mathrm{Par\_67}$ $\mathrm{Vffen}$ $\frac{\mathrm{Vfen}\mathrm{Ken\_pep}}{\mathrm{Ken\_2pg}\mathrm{Kapp\_ENOL}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfen}\mathrm{P2G}}{\mathrm{Ken\_2pg}}-\frac{\mathrm{Vben}\mathrm{PEP}}{\mathrm{Ken\_pep}}}{1+\frac{\mathrm{PEP}}{\mathrm{Ken\_pep}}+\frac{\mathrm{P2G}}{\mathrm{Ken\_2pg}}}$ $\mathrm{Par\_68}$ $\mathrm{Par\_69}$ $\mathrm{Par\_70}$ $\mathrm{Par\_71}$ $\mathrm{Par\_72}$ $\frac{\mathrm{Vffpk}\times 1.05}{1+10^{(-\mathrm{pH\_cy}+5.58)}+10^{(\mathrm{pH\_cy}-8.79)}}$ $\frac{\mathrm{Vfpk}\mathrm{Kpk\_pyr}\mathrm{Kpk\_atp}}{\mathrm{Kpk\_pep}\mathrm{Kpk\_adp}\mathrm{Kapp\_PK}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfpk}\mathrm{PEP}\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpk\_pep}\mathrm{Kpk\_adp}}-\frac{\mathrm{Vbpk}\mathrm{PYR}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpk\_pyr}\mathrm{Kpk\_atp}}}{1+\frac{\mathrm{PEP}}{\mathrm{Kpk\_pep}}+\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpk\_adp}}+\frac{\mathrm{PEP}\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kpk\_pep}\mathrm{Kpk\_adp}}+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpk\_atp}}+\frac{\mathrm{PYR}}{\mathrm{Kpk\_pyr}}+\frac{\mathrm{PYR}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kpk\_pyr}\mathrm{Kpk\_atp}}}$ $\mathrm{Par\_73}$ $\mathrm{Par\_74}$ $\mathrm{Par\_75}$ $\mathrm{Par\_76}$ $\mathrm{Par\_77}$ $\mathrm{Vffldh}(0.1134\mathrm{pH\_cy}+1.6069)$ $\frac{\mathrm{Vfldh}\mathrm{Kldh\_lac}\mathrm{Kldh\_nad}}{\mathrm{Kldh\_pyr}\mathrm{Kldh\_nadh}\mathrm{Kapp\_LDH}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfldh}\mathrm{PYR}\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kldh\_pyr}\mathrm{Kldh\_nadh}}-\frac{\mathrm{Vbldh}\mathrm{LAC}\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kldh\_lac}\mathrm{Kldh\_nad}}}{1+\frac{\mathrm{PYR}}{\mathrm{Kldh\_pyr}}+\frac{\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kldh\_nadh}}+\frac{\mathrm{PYR}\mathrm{NADH}}{\mathrm{Kldh\_pyr}\mathrm{Kldh\_nadh}}+\frac{\mathrm{LAC}}{\mathrm{Kldh\_lac}}+\frac{\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kldh\_nad}}+\frac{\mathrm{LAC}\mathrm{NAD}}{\mathrm{Kldh\_lac}\mathrm{Kldh\_nad}}}$ $\begin{cases}\mathrm{Par\_88} & \text{if $(\mathrm{expno}\neq 5)\land (\mathrm{expno}\neq 45)$}\\ \mathrm{Par\_88} & \text{if $(\mathrm{expno}\neq 5)\land (\mathrm{expno}=45)\land (\mathrm{time\_}\ge 110)$}\\ \mathrm{Par\_88} & \text{if $(\mathrm{expno}=5)\land (\mathrm{time\_}> 30)$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{Par\_89}$ $\frac{\mathrm{VmaxATPase}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Katp\_ATPase}+\mathrm{ATP}}$ $\mathrm{Par\_78}$ $\mathrm{Par\_79}$ $\mathrm{Par\_80}$ $\mathrm{Par\_81}$ $\mathrm{Par\_82}$ $\mathrm{Par\_83}$ $\frac{\frac{\mathrm{VforCK}}{\mathrm{Kapp\_CK}}\mathrm{Kck\_iatp}\mathrm{Kck\_cr}}{\mathrm{Kck\_iadp}\mathrm{Kck\_pcr}}$ $\frac{\frac{\mathrm{VrevCK}\mathrm{ATP}\mathrm{Cr}}{\mathrm{Kck\_iatp}\mathrm{Kck\_cr}}-\frac{\mathrm{VforCK}\mathrm{ADP}\mathrm{PCr}}{\mathrm{Kck\_iadp}\mathrm{Kck\_pcr}}}{1+\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kck\_iadp}}+\frac{\mathrm{PCr}}{\mathrm{Kck\_ipcr}}+\frac{\mathrm{PCr}\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kck\_iadp}\mathrm{Kck\_pcr}}+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kck\_iatp}}+\frac{\mathrm{Cr}\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kck\_cr}\mathrm{Kck\_iatp}}}$ $\mathrm{Par\_84}$ $\mathrm{Par\_85}$ $\mathrm{Par\_86}$ $\mathrm{Par\_87}$ $\frac{\mathrm{Vfadk}\mathrm{Kadk\_adp}^2}{\mathrm{Kadk\_amp}\mathrm{Kadk\_atp}\mathrm{Kapp\_ADK}}$ $\frac{\frac{\mathrm{Vfadk}\mathrm{ATP}\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kadk\_atp}\mathrm{Kadk\_amp}}-\mathrm{Vbadk}\left(\frac{\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kadk\_adp}}\right)^2}{1+\frac{\mathrm{ATP}}{\mathrm{Kadk\_atp}}+\frac{\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kadk\_amp}}+\frac{\mathrm{ATP}\mathrm{AMP}}{\mathrm{Kadk\_atp}\mathrm{Kadk\_amp}}+\frac{2\mathrm{ADP}}{\mathrm{Kadk\_adp}}+\frac{\mathrm{ADP}^2}{\mathrm{Kadk\_adp}^2}}$ $\mathrm{Par\_92}$ $\mathrm{Par\_91}$ $\mathrm{Par\_93}$ $\frac{\ln 10\mathrm{carnosine}10^{(-\mathrm{pH\_cy}-6.87)}}{(10^{-\mathrm{pH\_cy}}+10^{-6.87})^2}+\frac{\ln 10\mathrm{tris}10^{(-\mathrm{pH\_cy}-8.3)}}{(10^{-\mathrm{pH\_cy}}+10^{-8.3})^2}+\frac{\ln 10\mathrm{acetate}10^{(-\mathrm{pH\_cy}-4.8)}}{(10^{-\mathrm{pH\_cy}}+10^{-4.8})^2}$ $\ln 1010^{-\mathrm{pH\_cy}}\mathrm{c0}(1+\mathrm{dNavgPidH}\mathrm{Pi\_}+\mathrm{dNavgATPdH}\mathrm{ATP}+\mathrm{dNavgADPdH}\mathrm{ADP}+\mathrm{dNavgAMPdH}\mathrm{AMP}+\mathrm{dNavgPCRdH}\mathrm{PCr}+\mathrm{dNavgCRdH}\mathrm{Cr}+\mathrm{dNavgG1PdH}\mathrm{G1P}+\mathrm{dNavgG6PdH}\mathrm{G6P}+\mathrm{dNavgF6PdH}\mathrm{F6P}+\mathrm{dNavgFDPdH}\mathrm{FBP}+\mathrm{dNavgGAPdH}\mathrm{GAP}+\mathrm{dNavgDHAPdH}\mathrm{DHAP}+\mathrm{dNavgG3PdH}\mathrm{G3P}+\mathrm{dNavg13DPGdH}\mathrm{BPG}+\mathrm{dNavg3PGdH}\mathrm{P3G}+\mathrm{dNavg2PGdH}\mathrm{P2G}+\mathrm{dNavgPEPdH}\mathrm{PEP}+\mathrm{dNavgPYRdH}\mathrm{PYR}+\mathrm{dNavgLACdH}\mathrm{LAC})$ $\mathrm{deltaH\_CK}-\mathrm{CK}+\mathrm{deltaH\_ADK}\mathrm{ADK}+\mathrm{deltaH\_PGLM}\mathrm{v\_PGLM}+\mathrm{deltaH\_GP}(\mathrm{flux\_GPa}+\mathrm{flux\_GPb})+\mathrm{deltaH\_PGI}\mathrm{v\_PGI}+\mathrm{deltaH\_PFK}\mathrm{v\_PFK}+\mathrm{deltaH\_ALD}\mathrm{v\_ALD}+\mathrm{deltaH\_TPI}\mathrm{v\_TPI}+\mathrm{deltaH\_GAPDH}\mathrm{v\_GAPDH}+\mathrm{deltaH\_PGK}\mathrm{v\_PGK}+\mathrm{deltaH\_PGM}\mathrm{v\_PGM}+\mathrm{deltaH\_ENOL}\mathrm{v\_ENOL}+\mathrm{deltaH\_PK}\mathrm{v\_PK}+\mathrm{deltaH\_LDH}\mathrm{v\_LDH}+\mathrm{deltaH\_G3PDH}\mathrm{v\_G3PDH}$ $\mathrm{deltaH\_CK}-\mathrm{CK}$ $\mathrm{deltaH\_PGLM}\mathrm{v\_PGLM}+\mathrm{deltaH\_GP}(\mathrm{flux\_GPa}+\mathrm{flux\_GPb})+\mathrm{deltaH\_PGI}\mathrm{v\_PGI}+\mathrm{deltaH\_PFK}\mathrm{v\_PFK}+\mathrm{deltaH\_ALD}\mathrm{v\_ALD}+\mathrm{deltaH\_TPI}\mathrm{v\_TPI}+\mathrm{deltaH\_GAPDH}\mathrm{v\_GAPDH}+\mathrm{deltaH\_PGK}\mathrm{v\_PGK}+\mathrm{deltaH\_PGM}\mathrm{v\_PGM}+\mathrm{deltaH\_ENOL}\mathrm{v\_ENOL}+\mathrm{deltaH\_PK}\mathrm{v\_PK}+\mathrm{deltaH\_LDH}\mathrm{v\_LDH}+\mathrm{deltaH\_G3PDH}\mathrm{v\_G3PDH}$ $\frac{\mathrm{protons\_consumed}}{\mathrm{bufcapfixed}+\mathrm{bufcapmetab}}$ $\frac{\mathrm{dNavgPidmg}\mathrm{Pi\_}+\mathrm{dNavgATPdmg}\mathrm{ATP}+\mathrm{dNavgADPdmg}\mathrm{ADP}+\mathrm{dNavgAMPdmg}\mathrm{AMP}+\mathrm{dNavgPCRdmg}\mathrm{PCr}+\mathrm{dNavgCRdmg}\mathrm{Cr}+\mathrm{dNavgG1Pdmg}\mathrm{G1P}+\mathrm{dNavgG6Pdmg}\mathrm{G6P}+\mathrm{dNavgF6Pdmg}\mathrm{F6P}+\mathrm{dNavgFDPdmg}\mathrm{FBP}+\mathrm{dNavgGAPdmg}\mathrm{GAP}+\mathrm{dNavgDHAPdmg}\mathrm{DHAP}+\mathrm{dNavgG3Pdmg}\mathrm{G3P}+\mathrm{dNavg13DPGdmg}\mathrm{BPG}+\mathrm{dNavg3PGdmg}\mathrm{P3G}+\mathrm{dNavg2PGdmg}\mathrm{P2G}+\mathrm{dNavgPEPdmg}\mathrm{PEP}+\mathrm{dNavgPYRdmg}\mathrm{PYR}+\mathrm{dNavgLACdmg}\mathrm{LAC}}{\mathrm{bufcapfixed}+\mathrm{bufcapmetab}}$ $-1-\mathrm{dmgATP2dmg}\mathrm{ATP}+\mathrm{dmgADPdmg}\mathrm{ADP}+\mathrm{dmgAMPdmg}\mathrm{AMP}+\mathrm{dmgPidmg}\mathrm{Pi\_}+\mathrm{dmgPCRdmg}\mathrm{PCr}+\mathrm{dmgG1Pdmg}\mathrm{G1P}+\mathrm{dmgFDPdmg}\mathrm{FBP}+\mathrm{dmgG3Pdmg}\mathrm{G3P}+\mathrm{dmgDHAPdmg}\mathrm{DHAP}+\mathrm{dmgPEPdmg}\mathrm{PEP}+\mathrm{dmg2PGdmg}\mathrm{P2G}+\mathrm{dmgLACdmg}\mathrm{LAC}$ $\frac{\mathrm{dmgATP2dpH}\mathrm{ATP}+\mathrm{dmgADPdpH}\mathrm{ADP}+\mathrm{dmgAMPdpH}\mathrm{AMP}+\mathrm{dmgPidpH}\mathrm{Pi\_}+\mathrm{dmgPCRdpH}\mathrm{PCr}+\mathrm{dmgG1PdpH}\mathrm{G1P}+\mathrm{dmgFDPdpH}\mathrm{FBP}+\mathrm{dmgG3PdpH}\mathrm{G3P}+\mathrm{dmgDHAPdpH}\mathrm{DHAP}+\mathrm{dmgPEPdpH}\mathrm{PEP}+\mathrm{dmg2PGdpH}\mathrm{P2G}+\mathrm{dmgLACdpH}\mathrm{LAC}}{\mathrm{denom\_mgODE}}$ $1-\mathrm{RHSterm1\_mgODE}\mathrm{pHODEterm2}$ $\mathrm{dPCrdt}$ $\mathrm{dCrdt}$ $\mathrm{dNADdt}$ $\mathrm{dNADHdt}$ $\mathrm{dATPdt}$ $\mathrm{dADPdt}$ $\mathrm{dAMPdt}$ $\mathrm{dPidt}$ $\mathrm{dGlydt}$ $\mathrm{dG1Pdt}$ $\mathrm{dG6Pdt}$ $\mathrm{dF6Pdt}$ $\mathrm{dFBPdt}$ $\mathrm{dDHAPdt}$ $\mathrm{dG3Pdt}$ $\mathrm{dGAPdt}$ $\mathrm{dBGPdt}$ $\mathrm{dP3Gdt}$ $\mathrm{dP2Gdt}$ $\mathrm{dPEPdt}$ $\mathrm{dPYRdt}$ $\mathrm{dLACdt}$ $\frac{\mathrm{mgATP2}\mathrm{dATPdt}+\mathrm{mgADP}\mathrm{dADPdt}+\mathrm{mgAMP}\mathrm{dAMPdt}+\mathrm{mgPi}\mathrm{dPidt}+\mathrm{mgPCR}\mathrm{dPCrdt}+\mathrm{mgG1P}\mathrm{dG1Pdt}+\mathrm{mgFDP}\mathrm{dFBPdt}+\mathrm{mgG3P}\mathrm{dG3Pdt}+\mathrm{mgDHAP}\mathrm{dDHAPdt}+\mathrm{mgPEP}\mathrm{dPEPdt}+\mathrm{mg2PG}\mathrm{dP2Gdt}+\mathrm{mgLAC}\mathrm{dLACdt}}{\mathrm{denom\_mgODE}}$ $1$ $\begin{cases}\frac{\mathrm{fixmg}(\mathrm{RHSterm2\_mgODE}+\mathrm{RHSterm1\_mgODE}\mathrm{pHODEterm1})}{1-\mathrm{RHSterm1\_mgODE}\mathrm{pHODEterm2}} & \text{if $\mathrm{time\_}\le 1$}\\ \mathrm{fixmg}\mathrm{RHSterm2\_mgODE} & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{Par\_99}$ $\frac{\mathrm{fixpH}(\mathrm{pHODEterm1}+\mathrm{RHSterm2\_mgODE}\mathrm{pHODEterm2})}{1-\mathrm{RHSterm1\_mgODE}\mathrm{pHODEterm2}}$ $-\mathrm{protons\_consumed}$ $-\mathrm{CK}-\mathrm{ADK}-\mathrm{v\_PFK}+\mathrm{v\_PGK}+\mathrm{v\_PK}-\mathrm{ATPase}$ $\mathrm{CK}+2\mathrm{ADK}+\mathrm{v\_PFK}-\mathrm{v\_PGK}-\mathrm{v\_PK}+\mathrm{ATPase}$ $-\mathrm{ADK}$ $\mathrm{v\_ALD}+\mathrm{v\_TPI}+\mathrm{v\_G3PDH}$ $\mathrm{v\_PFK}-\mathrm{v\_ALD}$ $\mathrm{flux\_GPa}+\mathrm{flux\_GPb}-\mathrm{v\_PGLM}$ $-\mathrm{v\_G3PDH}$ $\mathrm{v\_LDH}$ $\mathrm{v\_PGM}-\mathrm{v\_ENOL}$ $\mathrm{CK}$ $\mathrm{v\_ENOL}-\mathrm{v\_PK}$ $-(\mathrm{flux\_GPa}+\mathrm{flux\_GPb})-\mathrm{v\_GAPDH}+\mathrm{ATPase}$ $-\mathrm{CK}$ $-\mathrm{v\_GAPDH}-\mathrm{v\_G3PDH}+\mathrm{v\_LDH}$ $\mathrm{v\_GAPDH}+\mathrm{v\_G3PDH}-\mathrm{v\_LDH}$ $-(\mathrm{flux\_GPa}+\mathrm{flux\_GPb})$ $\mathrm{v\_PGLM}-\mathrm{v\_PGI}$ $\mathrm{v\_PGI}-\mathrm{v\_PFK}$ $\mathrm{v\_ALD}-\mathrm{v\_TPI}-\mathrm{v\_GAPDH}$ $\mathrm{v\_GAPDH}-\mathrm{v\_PGK}$ $\mathrm{v\_PGK}-\mathrm{v\_PGM}$ $\mathrm{v\_PK}-\mathrm{v\_LDH}$