$9E2$ $3.49E4$ $1.55E4$ $2.224E2$ $3.49E4$ $4.73E3$ $1.67E3$ $1.3E4$ $5.48E4$ $\frac{\mathrm{V1}\frac{\mathrm{mATP}\mathrm{Cr}}{\mathrm{Kia}\mathrm{Kb}}-\mathrm{V1\_}\frac{\mathrm{mADP}\mathrm{PCr}}{\mathrm{Kic}\mathrm{Kd}}}{\mathrm{DenCK}}$ $\frac{\mathrm{Kic}\mathrm{Kd}}{\mathrm{Kid}}$ $1+\frac{\mathrm{Cr}}{\mathrm{Kib}}+\frac{\mathrm{PCr}}{\mathrm{Kid}}+\mathrm{mATP}(\frac{1}{\mathrm{Kia}}+\frac{\mathrm{Cr}}{\mathrm{Kia}\mathrm{Kb}})+\mathrm{mADP}(\frac{1}{\mathrm{Kic}}+\frac{\mathrm{PCr}}{\mathrm{Kid}\mathrm{Kc}}+\frac{\mathrm{Cr}}{\mathrm{Kic}\mathrm{KIb}})$ $\frac{\mathrm{ATP}}{1+\frac{\mathrm{Mg}}{\mathrm{KDT}}}$ $\frac{\mathrm{ATPx}}{1+\frac{\mathrm{Mgx}}{\mathrm{KDTx}}}$ $\frac{\mathrm{ATPext}}{1+\frac{\mathrm{Mgext}}{\mathrm{KDText}}}$ $\frac{\mathrm{ATPg}}{1+\frac{\mathrm{Mgg}}{\mathrm{KDTg}}}$ $\frac{\mathrm{ATPi}}{1+\frac{\mathrm{Mgi}}{\mathrm{KDTi}}}$ $\mathrm{ATP}-\mathrm{fATP}$ $\mathrm{ATPx}-\mathrm{fATPx}$ $\mathrm{ATPext}-\mathrm{fATPext}$ $\mathrm{ATPg}-\mathrm{fATPg}$ $\mathrm{ATPi}-\mathrm{fATPi}$ $\frac{\mathrm{ADP}}{1+\frac{\mathrm{Mg}}{\mathrm{KDD}}}$ $\frac{\mathrm{ADPx}}{1+\frac{\mathrm{Mgx}}{\mathrm{KDDx}}}$ $\frac{\mathrm{ADPext}}{1+\frac{\mathrm{Mgext}}{\mathrm{KDDext}}}$ $\frac{\mathrm{ADPg}}{1+\frac{\mathrm{Mgg}}{\mathrm{KDDg}}}$ $\frac{\mathrm{ADPi}}{1+\frac{\mathrm{Mgi}}{\mathrm{KDDi}}}$ $\mathrm{ADP}-\mathrm{fADP}$ $\mathrm{ADPx}-\mathrm{fADPx}$ $\mathrm{ADPext}-\mathrm{fADPext}$ $\mathrm{ADPg}-\mathrm{fADPg}$ $\mathrm{ADPi}-\mathrm{fADPi}$ $\mathrm{kfa}\mathrm{fADP}\mathrm{mADP}-\mathrm{kba}\mathrm{mATP}\mathrm{AMP}$ $\mathrm{kfa}\mathrm{fADP}\mathrm{mADP}-\mathrm{kba}\mathrm{mATP}\mathrm{AMP}$ $3.626E4$ $\begin{cases}\frac{\mathrm{time\_}}{30}\mathrm{H\_ATPmax} & \text{if $(\mathrm{time\_}\ge 0)\land (\mathrm{time\_}< 30)$}\\ \frac{60\mathrm{time\_}}{30}\mathrm{H\_ATPmax} & \text{if $(\mathrm{time\_}\ge 30)\land (\mathrm{time\_}< 60)$}\\ 0 & \text{if $(\mathrm{time\_}\ge 60)\land (\mathrm{time\_}< 180)$}\end{cases}$ $\begin{cases}0.94(1-\frac{x}{0.375}) & \text{if $(x< 0.375)\land (y< 1)$}\\ 1.61\frac{x-0.375}{0.375} & \text{if $(x\ge 0.375)\land (x< 0.75)\land (y< 1)$}\\ 1.61 & \text{if $(x\ge 0.375)\lor (y\ge 1)$}\end{cases}$ $\mathrm{G\_CK}$ $\begin{cases}\frac{4}{3}\frac{x}{0.125} & \text{if $(x< 0.125)\land (y< 1)$}\\ \frac{4}{3} & \text{if $(x\ge 0.125)\land (x< 0.75)\land (y< 1)$}\\ \frac{4}{3}(1-\frac{x-0.75}{0.125}) & \text{if $(x\ge 0.75)\land (x< 0.875)\land (y< 1)$}\\ 0 & \text{if $(x\ge 0.875)\lor (y\ge 1)$}\end{cases}$ $\frac{\mathrm{R\_ATP}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{ATP}-\mathrm{ATPi})+\frac{\mathrm{v\_ANT}}{\mathrm{FVi}}-\frac{\mathrm{v\_MiCK}}{\mathrm{FVi}}+\frac{\mathrm{v\_AKmit}}{\mathrm{FVi}}$ $\frac{\mathrm{R\_ADP}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{ADP}-\mathrm{ADPi})-\frac{2\mathrm{v\_AKmit}}{\mathrm{FVi}}+\frac{\mathrm{v\_ANT}}{\mathrm{FVi}}+\frac{\mathrm{v\_MiCK}}{\mathrm{FVi}}$ $\frac{\mathrm{R\_AMP}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{AMP}-\mathrm{AMPi})+\frac{\mathrm{v\_AKmit}}{\mathrm{FVi}}$ $\frac{\mathrm{R\_PCr}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{PCr}-\mathrm{PCri})+\frac{\mathrm{v\_AKmit}}{\mathrm{FVi}}$ $\frac{\mathrm{R\_Cr}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{Cr}-\mathrm{Cri})-\frac{\mathrm{v\_MiCK}}{\mathrm{FVi}}$ $\frac{\mathrm{R\_Pi}}{\mathrm{Li}}(\mathrm{Pi\_}-\mathrm{Pii})-\frac{\mathrm{v\_PI}}{\mathrm{FVi}}$ $7.7E3$ $2.97E4$ $7.12E2$ $1.61E2$ $1.42E2$ $1.1E4$ $5E2$ $5.2E3$ $2.6E4$ $1.6E3$ $2.6E4$ $\mathrm{v\_MiCK\_G}+\mathrm{v\_MiCK\_I}$ $\frac{\mathrm{V1}\frac{\mathrm{mATPg}\mathrm{Cri}}{\mathrm{Kia\_G}\mathrm{Kb}}-\mathrm{V1\_}\frac{\mathrm{mADPg}\mathrm{PCri}}{\mathrm{Kic\_G}\mathrm{Kd}}}{\mathrm{DenMiCK}}$ $\frac{\mathrm{V1}\frac{\mathrm{mATPi}\mathrm{Cri}}{\mathrm{Kia}\mathrm{Kb}}-\mathrm{V1\_}\frac{\mathrm{mADPi}\mathrm{PCri}}{\mathrm{Kic}\mathrm{Kd}}}{\mathrm{DenMiCK}}$ $1+\frac{\mathrm{Cri}}{\mathrm{Kib}}+\frac{\mathrm{PCri}}{\mathrm{Kid}}+(\frac{\mathrm{mATPg}}{\mathrm{Kia\_G}}+\frac{\mathrm{mATPi}}{\mathrm{Kia}})(1+\frac{\mathrm{Cri}}{\mathrm{Kb}})+(\frac{\mathrm{mADPg}}{\mathrm{Kic\_G}}+\frac{\mathrm{mADPi}}{\mathrm{Kic}})(1+\frac{\mathrm{PCri}}{\mathrm{Kd}}+\frac{\mathrm{Cri}}{\mathrm{KIb}})$ $\mathrm{R\_exch\_ATP}(\mathrm{ATPi}-\mathrm{ATPg})$ $\mathrm{R\_exch\_ADP}(\mathrm{ADPi}-\mathrm{ADPg})$ $\frac{\mathrm{v\_C3}-\mathrm{v\_C1}}{\mathrm{FVx}}$ $\frac{2(2\mathrm{v\_O2}-\mathrm{v\_C3})}{\mathrm{FVx}}$ $\frac{\mathrm{v\_C1}-\mathrm{v\_dh}}{\mathrm{FVx}}$ $\mathrm{delta\_Hx}$ $\frac{-(2(2+u)\mathrm{v\_O2}+4\mathrm{v\_C1}-4\mathrm{v\_C3}-\mathrm{na}\mathrm{v\_sn}+\mathrm{v\_ANT}u-1\mathrm{v\_PI}+\mathrm{v\_leak})}{\mathrm{FVx}\mathrm{r\_buff}}$ $\frac{\mathrm{v\_sn}-\mathrm{v\_ANT}}{\mathrm{FVx}}$ $\frac{\mathrm{v\_PI}-\mathrm{v\_sn}}{\mathrm{FVx}}$ $2.1895E3$ $5.75E4$ $2.96E4$ $2E2$ $1.142E2$ $2.4E2$ $\frac{\mathrm{k\_dh}}{(1+\frac{\mathrm{k\_mN}}{\frac{\mathrm{NAD}}{\mathrm{NADH}}})^{\mathrm{pD}}}$ $\mathrm{k\_C1}(\mathrm{Eu}-\mathrm{En}+2\mathrm{delta\_p})$ $\mathrm{k\_C3}(\mathrm{Ec}-\mathrm{Eu}-2\mathrm{delta\_p})$ $0.5\mathrm{k\_C4}\mathrm{a2plus}\mathrm{c2plus}\frac{\mathrm{O2}}{\mathrm{O2}+\mathrm{k\_mO}}$ $\mathrm{k\_sn}\frac{10^{\left(\frac{\mathrm{delta\_Gsn}}{Z}\right)}-1}{10^{\left(\frac{\mathrm{delta\_Gsn}}{Z}\right)}+1}$ $\mathrm{k\_L1}(10^{(\mathrm{k\_L2}\mathrm{delta\_p})}-1)$ $\mathrm{vfPI}\mathrm{Hext}\frac{\mathrm{Pii}}{1+10^{(\mathrm{pHext}-\mathrm{pKa})}}-\mathrm{vbPI}\mathrm{Hx}\frac{\mathrm{Pix}}{1+10^{(\mathrm{pHx}-\mathrm{pKa})}}$ $2.97E3$ $\mathrm{NAD\_tot}-\mathrm{NAD}$ $1.35E3$ $\mathrm{UQ\_tot}-\mathrm{UQ}$ $2.7E2$ $\mathrm{ctot}-\mathrm{c3plus}$ $1.35E2$ $\mathrm{atot}-\mathrm{a3\_2}$ $1E4$ $\mathrm{Ax}-\mathrm{ATPx}$ $-\ln (\mathrm{eta}\mathrm{Hx})$ $Z(\mathrm{pHext}-\mathrm{pHx})$ $\frac{1}{1-u}\mathrm{delta\_pH}$ $-(\mathrm{delta\_p}-\mathrm{delta\_pH})$ $\mathrm{eta}1^{-\mathrm{pHext}}$ $\mathrm{r\_buff0}\mathrm{eta}\frac{\mathrm{delta\_pH}}{\mathrm{delta\_Hx}}$ $\ln 10\frac{RT}{F}$ $\mathrm{v\_ANT\_XG}+\mathrm{v\_ANT\_XI}$ $\mathrm{na}\mathrm{delta\_p}-\frac{\mathrm{delta\_Gsn0}}{F}+Z\ln \left(\frac{\mathrm{eta}\mathrm{ATPx}}{\mathrm{ADPx}\mathrm{Pix}}\right)$ $\mathrm{En0}+\frac{Z}{2}\ln \left(\frac{\mathrm{NAD}}{\mathrm{NADH}}\right)$ $\mathrm{Eu0}+\frac{Z}{2}\ln \left(\frac{\mathrm{UQ}}{\mathrm{UQH2}}\right)$ $\mathrm{Ec0}+\frac{Z}{2}\ln \left(\frac{\mathrm{c3plus}}{\mathrm{c2plus}}\right)$ $\mathrm{Ec}+(1+u)\mathrm{delta\_p}$ $10^{((\mathrm{Ea}-\mathrm{Ea0})Z)}$ $1.45E2$ $1.45E2$ $1.45E2$ $2.6E2$ $2.6E2$ $3.27E2$ $1E3$ $10E6$