$\frac{\mathrm{len\_sovr}\times 2}{\mathrm{len\_thick}-\mathrm{len\_hbare}}$ $\frac{\mathrm{len\_sovr}}{\mathrm{len\_thin}}$ $\begin{cases}\frac{\mathrm{len\_thick}}{2} & \text{if $\frac{\mathrm{len\_thick}}{2}< \frac{\mathrm{SL}}{2}$}\\ \frac{\mathrm{SL}}{2} & \text{otherwise}\end{cases}$ $\begin{cases}\frac{\mathrm{SL}}{2}-\mathrm{SL}-\mathrm{len\_thin} & \text{if $\frac{\mathrm{SL}}{2}-\mathrm{SL}-\mathrm{len\_thin}> \frac{\mathrm{len\_hbare}}{2}$}\\ \frac{\mathrm{len\_hbare}}{2} & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{sovr\_ze}-\mathrm{sovr\_cle}$ $\mathrm{dTRPNCaL}$ $\mathrm{dTRPNCaH}$ $\mathrm{konT}\mathrm{Cai}(1-\mathrm{TRPNCaL})-\mathrm{koffLT}\mathrm{TRPNCaL}$ $\mathrm{konT}\mathrm{Cai}(1-\mathrm{TRPNCaH})-\mathrm{koffHT}\mathrm{TRPNCaH}$ $\mathrm{kn\_p}\mathrm{permtot}\mathrm{Qkn\_p}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{kp\_n}\mathrm{inprmt}\mathrm{Qkp\_n}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $10E610^{-\mathrm{pH}}$ $10E610^{-7.15}$ $\frac{\mathrm{kdHCa}^m+\mathrm{H\_cons}^m}{\mathrm{kdHCa}^m+H^m}\mathrm{kon}\mathrm{Qkon}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{koffL}\mathrm{koffmod}\mathrm{Qkoff}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{koffH}\mathrm{koffmod}\mathrm{Qkoff}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $1\mathrm{TRPNCaL}+\mathrm{SOVFThin}\mathrm{TRPNCaH}$ $\sqrt{\left|\frac{1}{1+\left(\frac{\mathrm{perm50}}{\mathrm{Tropreg}}\right)^{\mathrm{nperm}}}\right|}$ $\begin{cases}\frac{1}{\mathrm{permtot}} & \text{if $\frac{1}{\mathrm{permtot}}< 100$}\\ 100 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{fapp}\mathrm{xbmodsp}\mathrm{Qfapp}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{gapp}\mathrm{gapslmd}\mathrm{xbmodsp}\mathrm{Qgapp}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{hf}\mathrm{hfmd}\mathrm{xbmodsp}\mathrm{Qhf}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{hb}\mathrm{hbmd}\mathrm{xbmodsp}\mathrm{Qhb}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $\mathrm{gxb}\mathrm{gxbmd}\mathrm{xbmodsp}\mathrm{Qgxb}^{\left(\frac{\mathrm{TmpC}-37}{10}\right)}$ $e^{\frac{-\mathrm{xXBprer}}{\left|\mathrm{xXBprer}\right|}\mathrm{hfmdc}\left(\frac{\mathrm{xXBprer}}{\mathrm{x\_0}}\right)^2}$ $e^{\frac{\mathrm{xXBpostr}-\mathrm{x\_0}}{\left|\mathrm{xXBpostr}-\mathrm{x\_0}\right|}\mathrm{hbmdc}\left(\frac{\mathrm{xXBpostr}-\mathrm{x\_0}}{\mathrm{x\_0}}\right)^2}$ $\begin{cases}e^{\mathrm{sigmap}\left(\frac{\mathrm{x\_0}-\mathrm{xXBpostr}}{\mathrm{x\_0}}\right)^2} & \text{if $\mathrm{xXBpostr}< \mathrm{x\_0}$}\\ e^{\mathrm{sigman}\left(\frac{\mathrm{xXBpostr}-\mathrm{x\_0}}{\mathrm{x\_0}}\right)^2} & \text{otherwise}\end{cases}$ $1-1\mathrm{gslmod}$ $\mathrm{dXBpostr}$ $\mathrm{dXBprer}$ $\mathrm{alpha3\_minus}P+\mathrm{alpha2\_plus}\mathrm{XBprer}-(\mathrm{alpha2\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus})\mathrm{XBpostr}$ $\mathrm{alpha1\_plus}P+\mathrm{alpha2\_minus}\mathrm{XBpostr}-(\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha2\_plus})\mathrm{XBprer}$ $\mathrm{fappT}$ $\mathrm{hfT}$ $\mathrm{MgATP}\frac{\mathrm{gxbT}}{\mathrm{MgATP\_cons}}\frac{\mathrm{kdADP}+\mathrm{MgADP\_cons}}{\mathrm{kdADP}+\mathrm{MgADP}}$ $\mathrm{xPi}\frac{\mathrm{gappT}}{\mathrm{xPi\_cons}}$ $H\frac{\mathrm{hbT}}{\mathrm{H\_cons}}\frac{\mathrm{kdADP}+\mathrm{MgADP\_cons}}{\mathrm{MgADP\_cons}}\frac{\mathrm{MgADP}}{\mathrm{kdADP}+\mathrm{MgADP}}$ $\mathrm{fxbT}$ $\frac{\mathrm{kdADP}\mathrm{fappT}\mathrm{hfT}\frac{\mathrm{gxbT}}{\mathrm{MgATP\_cons}}}{\frac{\mathrm{gappT}}{\mathrm{xPi\_cons}}\frac{\mathrm{hbT}}{\mathrm{H\_cons}}\mathrm{kMgATP}}$ $\mathrm{kp\_nT}\mathrm{P\_NoXB}-\mathrm{kn\_pT}\mathrm{N\_NoXB}$ $\mathrm{kn\_pT}\mathrm{N\_NoXB}-\mathrm{kp\_nT}\mathrm{P\_NoXB}$ $\mathrm{kn\_pT}N-(\mathrm{kp\_nT}+\mathrm{alpha1\_plus})P$ $1-P+\mathrm{XBprer}+\mathrm{XBpostr}$ $\mathrm{dxXBpostr}$ $\mathrm{dxXBprer}$ $\frac{\mathrm{dSL}}{2}+\frac{\mathrm{xPsi}}{\mathrm{dutypostr}}\mathrm{alpha2\_plus}(\mathrm{xXBprer}+\mathrm{x\_0}-\mathrm{xXBpostr})$ $\frac{\mathrm{dSL}}{2}+\frac{\mathrm{xPsi}}{\mathrm{dutyprer}}(-(\mathrm{alpha1\_plus}\mathrm{xXBprer})+\mathrm{alpha2\_minus}(\mathrm{xXBpostr}-\mathrm{x\_0}+\mathrm{xXBprer}))$ $\frac{\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus}\mathrm{alpha1\_plus}+\mathrm{alpha2\_minus}\mathrm{alpha1\_plus}}{\mathrm{alpha1\_plus}\mathrm{alpha2\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus}\mathrm{alpha1\_plus}+\mathrm{alpha2\_minus}\mathrm{alpha1\_plus}+\mathrm{alpha2\_plus}\mathrm{alpha3\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus}\mathrm{alpha1\_minus}}$ $\frac{\mathrm{alpha1\_plus}\mathrm{alpha2\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_plus}}{\mathrm{alpha1\_plus}\mathrm{alpha2\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha2\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus}\mathrm{alpha1\_plus}+\mathrm{alpha2\_minus}\mathrm{alpha1\_plus}+\mathrm{alpha2\_plus}\mathrm{alpha3\_plus}+\mathrm{alpha3\_minus}\mathrm{alpha1\_minus}+\mathrm{alpha3\_plus}\mathrm{alpha1\_minus}}$ $\frac{\mathrm{fapp}\mathrm{hf}+\mathrm{fxb}\mathrm{gapp}+\mathrm{fxb}\mathrm{hb}}{\mathrm{hf}\mathrm{gxb}+\mathrm{hb}\mathrm{gapp}+\mathrm{gxb}\mathrm{gapp}+\mathrm{fxb}\mathrm{hb}+\mathrm{gxb}\mathrm{fapp}+\mathrm{hb}\mathrm{fapp}+\mathrm{fxb}\mathrm{gapp}+\mathrm{fapp}\mathrm{hf}+\mathrm{fxb}\mathrm{hb}}$ $\frac{\mathrm{fxb}\mathrm{hb}+\mathrm{gxb}\mathrm{fapp}+\mathrm{hbT}\mathrm{fapp}}{\mathrm{hf}\mathrm{gxb}+\mathrm{hb}\mathrm{gapp}+\mathrm{gxb}\mathrm{gapp}+\mathrm{fxb}\mathrm{hb}+\mathrm{gxb}\mathrm{fapp}+\mathrm{hb}\mathrm{fapp}+\mathrm{fxb}\mathrm{gapp}+\mathrm{fapp}\mathrm{hf}+\mathrm{fxb}\mathrm{hb}}$ $0$ $\mathrm{dSL}$ $\mathrm{kxb}\mathrm{x\_0}\mathrm{SSXBpostr}$ $\mathrm{kxb}\mathrm{SOVFThick}(\mathrm{xXBpostr}\mathrm{XBpostr}+\mathrm{xXBprer}\mathrm{XBprer})$ $\frac{1\mathrm{force}}{\mathrm{Fnordv}}$ $\mathrm{ppforce\_t}+\mathrm{ppforce\_c}$ $\frac{\mathrm{SL}-\mathrm{SLrest}}{\left|\mathrm{SL}-\mathrm{SLrest}\right|}\mathrm{PCon\_t}(e^{\mathrm{PExp\_t}\left|\mathrm{SL}-\mathrm{SLrest}\right|}-1)$ $\begin{cases}\mathrm{PCon\_c}(e^{\mathrm{PExp\_c}\left|\mathrm{SL}-\mathrm{SL\_c}\right|}-1) & \text{if $\mathrm{SL}> \mathrm{SL\_c}$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\frac{\left|\mathrm{SLset}-\mathrm{SLrest}\right|}{\mathrm{SLset}-\mathrm{SLrest}}\mathrm{PCon\_t}(e^{\mathrm{PExp\_t}\left|\mathrm{SLset}-\mathrm{SLrest}\right|}-1)$ $\begin{cases}\mathrm{KSE}(\mathrm{SLset}-\mathrm{SL}) & \text{if $\mathrm{SEon}=1$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{preload}+\mathrm{afterload}-\mathrm{ppforce}+\mathrm{active}$ $\frac{\mathrm{kdADP}\mathrm{fapp}\mathrm{hf}\frac{\mathrm{gxb}}{\mathrm{MgATP\_cons}}}{\frac{\mathrm{gapp}}{\mathrm{xPi\_cons}}\frac{\mathrm{hb}}{\mathrm{H\_cons}}\mathrm{kMgATP}}$ $\frac{\mathrm{XBpostr}+\mathrm{XBprer}}{\mathrm{SSXBpostr}+\mathrm{SSXBprer}}$ $\frac{\mathrm{dXBpostr}+\mathrm{dXBprer}}{\mathrm{SSXBpostr}+\mathrm{SSXBprer}}$ $\begin{cases}-0.5\mathrm{dSL} & \text{if $\mathrm{SL}< \mathrm{len\_thick}$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\begin{cases}-0.5\mathrm{dSL} & \text{if $2\mathrm{len\_thin}-\mathrm{SL}> \mathrm{len\_hbare}$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $\mathrm{dsovr\_ze}-\mathrm{dsovr\_cle}$ $\frac{2\mathrm{dlen\_sovr}}{\mathrm{len\_thick}-\mathrm{len\_hbare}}$ $\frac{\mathrm{dlen\_sovr}}{\mathrm{len\_thin}}$ $\mathrm{kxb}\mathrm{dSOVFThick}(\mathrm{xXBpostr}\mathrm{XBpostr}+\mathrm{xXBprer}\mathrm{XBprer})+\mathrm{kxb}\mathrm{SOVFThick}(\mathrm{dxXBpostr}\mathrm{XBpostr}+\mathrm{xXBpostr}\mathrm{dXBpostr}+\mathrm{dxXBprer}\mathrm{XBprer}+\mathrm{xXBprer}\mathrm{dXBprer})$ $\mathrm{Trop\_conc}(1\mathrm{TRPNCaL}+\mathrm{SOVFThin}(\mathrm{FrSBXB}\mathrm{TRPNCaH}-1\mathrm{TRPNCaL}))$ $\mathrm{Trop\_conc}(\mathrm{dSOVFThin}\mathrm{TRPNCaL}-1\mathrm{dTRPNCaL}+\mathrm{dSOVFThin}(\mathrm{FrSBXB}\mathrm{TRPNCaH}-1\mathrm{TRPNCaL})+\mathrm{SOVFThin}(\mathrm{dFrSBXB}\mathrm{TRPNCaH}+\mathrm{FrSBXB}\mathrm{dTRPNCaH}-1\mathrm{dTRPNCaL}-\mathrm{dFrSBXB}\mathrm{TRPNCaL}))$