$110^{-\mathrm{pH\_e}}$ $110^{-6.75}$ $110^{-6.48}$ $110^{-6.29}$ $0.9\mathrm{W\_m}$ $0.1\mathrm{W\_m}$ $\mathrm{H\_e}$ $\mathrm{K\_e}$ $F\mathrm{dPsi}+\mathrm{RT}\ln \left(\frac{\mathrm{H\_i}}{\mathrm{H\_x}}\right)$ $\frac{\mathrm{x\_DH}(r\mathrm{NAD\_x}-\mathrm{NADH\_x})(1+\frac{\mathrm{Pi\_x}}{\mathrm{k\_Pi1}})}{1+\frac{\mathrm{Pi\_x}}{\mathrm{k\_Pi2}}}$ $\mathrm{x\_C1}(e^{\frac{-(\mathrm{dG\_C1op}+4\mathrm{dG\_H})}{\mathrm{RT}}}\mathrm{NADH\_x}-\mathrm{NAD\_x})$ $\mathrm{dG\_C1o}-\mathrm{RT}\ln \left(\frac{\mathrm{H\_x}}{1E-7}\right)-\mathrm{RT}\ln \left(\frac{Q}{\mathrm{QH2}}\right)$ $\frac{\mathrm{x\_C3}(1+\frac{\mathrm{Pi\_x}}{\mathrm{k\_Pi3}})}{1+\frac{\mathrm{Pi\_x}}{\mathrm{k\_Pi4}}}(e^{\frac{-(\mathrm{dG\_C3op}+4\mathrm{dG\_H}-2F\mathrm{dPsi})}{2\mathrm{RT}}}\mathrm{Cox}-\mathrm{Cred})$ $\mathrm{dG\_C3o}+2\mathrm{RT}\ln \left(\frac{\mathrm{H\_x}}{1E-7}\right)-\mathrm{RT}\ln \left(\frac{\mathrm{QH2}}{Q}\right)$ $\frac{\frac{\mathrm{x\_C4}\times 1}{1+\frac{\mathrm{k\_O2}}{\mathrm{O2}}}\mathrm{Cred}}{\mathrm{Ctot}}(e^{\frac{-(\mathrm{dG\_C4op}+2\mathrm{dG\_H})}{2\mathrm{RT}}}\mathrm{Cred}-\mathrm{Cox}e^{\frac{F\mathrm{dPsi}}{\mathrm{RT}}})$ $\mathrm{dG\_C4o}-2\mathrm{RT}\ln \left(\frac{\mathrm{H\_x}}{1E-7}\right)-\frac{\mathrm{RT}}{2}\ln \left(\frac{\mathrm{O2}}{1}\right)$ $\mathrm{x\_F1}(\frac{e^{\frac{-(\mathrm{dG\_F1o}-\mathrm{n\_A}\mathrm{dG\_H})}{\mathrm{RT}}}\mathrm{K\_DD}}{\mathrm{K\_DT}}\mathrm{ADP\_mx}\mathrm{Pi\_x}-\mathrm{ATP\_mx}\times 1)$ $\begin{cases}\frac{\mathrm{x\_ANT}(\frac{\mathrm{ADP\_fi}}{\mathrm{ADP\_fi}+\mathrm{ATP\_fi}e^{\frac{-F\mathrm{Psi\_i}}{\mathrm{RT}}}}-\frac{\mathrm{ADP\_fx}}{\mathrm{ADP\_fx}+\mathrm{ATP\_fx}e^{\frac{-F\mathrm{Psi\_x}}{\mathrm{RT}}}})\mathrm{ADP\_fi}}{\mathrm{k\_mADP}+\mathrm{ADP\_fi}} & \text{if $(\mathrm{ADP\_fi}> \mathrm{mincond})\lor (\mathrm{ATP\_fi}> \mathrm{mincond})$}\\ 0 & \text{otherwise}\end{cases}$ $-0.65\mathrm{dPsi}$ $0.35\mathrm{dPsi}$ $\mathrm{x\_MgA}(\mathrm{ATP\_fx}\mathrm{Mg\_x}-\mathrm{K\_DT}\mathrm{ATP\_mx})$ $\mathrm{ATP\_x}-\mathrm{ATP\_mx}$ $\mathrm{x\_MgA}(\mathrm{ADP\_fx}\mathrm{Mg\_x}-\mathrm{K\_DD}\mathrm{ADP\_mx})$ $\mathrm{ADP\_x}-\mathrm{ADP\_mx}$ $\mathrm{x\_MgA}(\mathrm{ATP\_fi}\mathrm{Mg\_i}-\mathrm{K\_DT}\mathrm{ATP\_mi})$ $\mathrm{ATP\_i}-\mathrm{ATP\_mi}$ $\mathrm{x\_MgA}(\mathrm{ADP\_fi}\mathrm{Mg\_i}-\mathrm{K\_DD}\mathrm{ADP\_mi})$ $\mathrm{ADP\_i}-\mathrm{ADP\_mi}$ $\mathrm{gamma}\mathrm{p\_A}(\mathrm{ATP\_e}-\mathrm{ATP\_i})$ $\mathrm{gamma}\mathrm{p\_A}(\mathrm{ADP\_e}-\mathrm{ADP\_i})$ $\mathrm{gamma}\mathrm{p\_A}(\mathrm{AMP\_e}-\mathrm{AMP\_i})$ $\mathrm{gamma}\mathrm{x\_Pi2}(\mathrm{Pi\_e}-\mathrm{Pi\_i})$ $\frac{\mathrm{x\_Pi1}(\mathrm{H\_x}\mathrm{H2PIi}-\mathrm{H\_i}\mathrm{H2PIx})}{\mathrm{H2PIi}+\mathrm{k\_PiH}}$ $\frac{\mathrm{Pi\_i}\mathrm{H\_i}}{\mathrm{H\_i}+\mathrm{k\_dHPi}}$ $\frac{\mathrm{Pi\_x}\mathrm{H\_x}}{\mathrm{H\_x}+\mathrm{k\_dHPi}}$ $\mathrm{x\_AK}(\mathrm{K\_AK}\mathrm{ADP\_i}\mathrm{ADP\_i}-\mathrm{AMP\_i}\mathrm{ATP\_i})$ $\frac{\mathrm{x\_Hle}\mathrm{dPsi}(\mathrm{H\_i}e^{\frac{F\mathrm{dPsi}}{\mathrm{RT}}}-\mathrm{H\_x})}{e^{\frac{F\mathrm{dPsi}}{\mathrm{RT}}}-1}$ $\frac{\mathrm{x\_K}\mathrm{dPsi}(\mathrm{K\_i}e^{\frac{F\mathrm{dPsi}}{\mathrm{RT}}}-\mathrm{K\_x})}{e^{\frac{F\mathrm{dPsi}}{\mathrm{RT}}}-1}$ $\mathrm{x\_KH}(\mathrm{K\_i}\mathrm{H\_x}-\mathrm{K\_x}\mathrm{H\_i})$ $\mathrm{NADtot}-\mathrm{NADH\_x}$ $\mathrm{Qtot}-\mathrm{QH2}$ $\mathrm{Ctot}-\mathrm{Cred}$ $\frac{\mathrm{K\_DD}+\mathrm{ADP\_e}+\mathrm{Mg\_tot}-\sqrt{(\mathrm{K\_DD}+\mathrm{ADP\_e}+\mathrm{Mg\_tot})^2-4\mathrm{Mg\_tot}\mathrm{ADP\_e}}}{2}$ $\mathrm{ADP\_e}-\mathrm{ADP\_me}$ $\mathrm{Mg\_tot}-\mathrm{ADP\_me}$ $\mathrm{Mg\_e}$ $\frac{\mathrm{x\_buff}\mathrm{H\_x}(\mathrm{J\_DH}-5\mathrm{J\_C1}-2\mathrm{J\_C3}-4\mathrm{J\_C4}-\mathrm{n\_A}\mathrm{J\_F1}+2\mathrm{J\_Pi1}+\mathrm{J\_Hle}-\mathrm{J\_KH})}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_KH}+\mathrm{J\_K}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{-\mathrm{J\_MgATPx}-\mathrm{J\_MgADPx}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_DH}-\mathrm{J\_C1}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_C1}-\mathrm{J\_C3}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{2\mathrm{J\_C3}-2\mathrm{J\_C4}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{\mathrm{J\_F1}-\mathrm{J\_ANT}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{-\mathrm{J\_F1}+\mathrm{J\_ANT}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_MgATPx}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_MgADPx}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{-\mathrm{J\_F1}+\mathrm{J\_Pi1}}{\mathrm{W\_x}}$ $\frac{\mathrm{J\_ATP}+\mathrm{J\_ANT}+\mathrm{J\_AKi}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{\mathrm{J\_ADP}-\mathrm{J\_ANT}-2\mathrm{J\_AKi}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{\mathrm{J\_AMP}+\mathrm{J\_AKi}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{\mathrm{J\_MgATPi}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{\mathrm{J\_MgADPi}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{-\mathrm{J\_Pi1}+\mathrm{J\_Pi2}}{\mathrm{W\_i}}$ $\frac{4\mathrm{J\_C1}+2\mathrm{J\_C3}+4\mathrm{J\_C4}-\mathrm{n\_A}\mathrm{J\_F1}-\mathrm{J\_ANT}-\mathrm{J\_Hle}-\mathrm{J\_K}}{\mathrm{C\_im}}$ $0$