$-\mathrm{J\_0}+\mathrm{J\_f0}+\mathrm{J\_Casp8}-\mathrm{r\_19NO}-\mathrm{r\_20NO}$ $\mathrm{J\_0}-\mathrm{J\_f0}$ $\mathrm{k\_10}\mathrm{Casp8}\mathrm{Bid}-\mathrm{k\_00}\mathrm{Casp8Bid}$ $\mathrm{k\_f0}\mathrm{Casp8Bid}$ $-u\mathrm{Casp8}$ $\mathrm{k\_20NO}\mathrm{FeLnNO}\mathrm{Casp8}$ $-\mathrm{J\_1}+\mathrm{J\_Apaf\_1}$ $\mathrm{P\_Apaf\_1}-u\mathrm{Apaf\_1}$ $\mathrm{k\_11}\mathrm{Cytc}\mathrm{Apaf\_1}-\mathrm{k\_01}\mathrm{CytcApaf\_1}$ $\mathrm{J\_1}-7\mathrm{J\_1b}$ $\mathrm{k\_11b}\mathrm{CytcApaf\_1}^p-\mathrm{k\_01b}\mathrm{Apop}$ $\mathrm{J\_14}-\mathrm{J\_1}+\mathrm{J\_Cytc}+\mathrm{k\_1}\mathrm{PTPC\_act}\mathrm{Cytc\_mito}$ $\mathrm{PTPC\_0}-\mathrm{PTPC}$ $-u\mathrm{Cytc}$ $-\mathrm{J\_14}+\mathrm{J\_Cytc\_mito}$ $\mathrm{k14}\mathrm{Bax\_2}\mathrm{Cytc\_mito}$ $\mathrm{P\_Cytc\_mito}-u\mathrm{Cytc\_mito}$ $\mathrm{J\_12b}+\mathrm{J\_Bax\_2}$ $-u\mathrm{Bax\_2}$ $\mathrm{J\_11}-\mathrm{J\_12a}+\mathrm{J\_tBid\_mito}$ $\mathrm{k12a}\mathrm{tBid\_mito}\mathrm{Bax}$ $-u\mathrm{tBid\_mito}$ $\mathrm{J\_f0}+\mathrm{J\_f8}-\mathrm{J\_11}+\mathrm{J\_12b}+\mathrm{J\_tBid}$ $\mathrm{k11}\mathrm{tBid}$ $-u\mathrm{tBid}$ $\mathrm{J\_12a}-\mathrm{J\_12b}+\mathrm{J\_tBidBax}$ $\mathrm{k12b}\mathrm{tBidBax}\mathrm{Bax}$ $-u\mathrm{tBidBax}$ $-\mathrm{J\_12a}-\mathrm{J\_12b}-\mathrm{J\_13}+\mathrm{J\_Bax}$ $\mathrm{k13}\mathrm{Bcl\_2}\mathrm{Bax}$ $\mathrm{P\_Bax}-\mathrm{u\_Bax}\mathrm{Bax}$ $\mathrm{P\_oBax}(1+\frac{\mathrm{p53}^4}{\mathrm{p53}^4+\mathrm{p53\_thresh}^4})$ $-\mathrm{J\_9}-\mathrm{J\_13}+\mathrm{J\_Bcl\_2}$ $\mathrm{k\_19}\mathrm{Casp3}\mathrm{Bcl\_2}-\mathrm{k\_09}\mathrm{Casp3Bcl\_2}$ $\mathrm{P\_Bcl\_2}-\mathrm{u\_Bcl\_2}\mathrm{Bcl\_2}$ $\frac{\mathrm{P\_oBcl\_2}\mathrm{p53\_thresh}^4}{\mathrm{p53}^4+\mathrm{p53\_thresh}^4}$ $\mathrm{J\_9}-\mathrm{J\_f9}$ $\mathrm{k\_f9}\mathrm{Casp3Bcl\_2}$ $\mathrm{J\_8}-\mathrm{J\_f8}$ $\mathrm{k\_18}\mathrm{Casp3}\mathrm{Bid}-\mathrm{k\_08}\mathrm{Casp3Bid}$ $\mathrm{k\_f8}\mathrm{Casp3Bid}$ $-\mathrm{J\_0}-\mathrm{J\_8}+\mathrm{J\_Bid}$ $\mathrm{P\_Bid}-u\mathrm{Bid}$ $\mathrm{J\_f6}+\mathrm{J\_f6b}-\mathrm{J\_7}-\mathrm{J\_8}+\mathrm{J\_f8}-\mathrm{J\_9}+\mathrm{J\_f9}+\mathrm{J\_Casp3}-\mathrm{r\_22NO}$ $\mathrm{J\_7}$ $\mathrm{k\_17}\mathrm{Casp3}\mathrm{IAP}-\mathrm{k\_07}\mathrm{Casp3IAP}$ $-u\mathrm{Casp3}$ $\mathrm{J\_1b}-\mathrm{J\_2}+\mathrm{J\_4b}$ $-\mathrm{J\_2}-\mathrm{J\_3}+\mathrm{J\_Pro9}$ $\mathrm{J\_2}-\mathrm{J\_3}$ $\mathrm{k\_12}\mathrm{Apop}\mathrm{Pro9}-\mathrm{k\_02}\mathrm{ApopPro9}$ $\mathrm{k\_13}\mathrm{ApopPro9}\mathrm{Pro9}-\mathrm{k\_03}\mathrm{ApopPro9\_2}$ $\mathrm{P\_Pro9}-u\mathrm{Pro9}$ $\mathrm{J\_3}-\mathrm{J\_f3}$ $\mathrm{k\_f3}\mathrm{ApopPro9\_2}$ $\mathrm{J\_6b}-\mathrm{J\_f6b}$ $\mathrm{k\_16b}\mathrm{ApopCasp9\_2}\mathrm{Pro3}-\mathrm{k\_06b}\mathrm{ApopCasp9\_2Pro3}$ $\mathrm{k\_f6b}\mathrm{ApopCasp9\_2Pro3}$ $\mathrm{J\_6}-\mathrm{J\_f6}$ $\mathrm{k\_f6}\mathrm{Casp9Pro3}$ $-\mathrm{J\_6}-\mathrm{J\_6b}+\mathrm{J\_Pro3}$ 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$\mathrm{r\_1NO}-\mathrm{r\_4NO}-2\mathrm{r\_12aNO}-\mathrm{r\_12bNOp}+\mathrm{r\_12bNOm}+\mathrm{r\_14NO}-\mathrm{r\_15NO}-\mathrm{r\_16NO}$ $2\mathrm{r\_12aNO}-\mathrm{r\_12bNOp}+\mathrm{r\_12bNOm}$ $-\mathrm{r\_15NO}$ $\mathrm{k\_1NO}$ $\mathrm{k\_4NO}\mathrm{NO}\mathrm{O\_2m}$ $\mathrm{k\_12aNO}\mathrm{NO}^2\mathrm{O\_2}$ $\mathrm{k\_12bNOp}\mathrm{NO\_2}\mathrm{NO}$ $\mathrm{k\_12bNOm}\mathrm{N2O3}$ $\mathrm{k\_14NO}\mathrm{GSNO}$ $\mathrm{k\_15NO}\mathrm{CcOX}\mathrm{NO}$ $\mathrm{k\_16NO}\mathrm{FeLn}\mathrm{NO}$ $\mathrm{r\_2NO}-\mathrm{r\_4NO}-\mathrm{r\_5NO}-\mathrm{r\_10NO}$ $\mathrm{k\_2NO}$ $\mathrm{k\_5NO}\mathrm{SOD}\mathrm{O\_2m}$ $\mathrm{k\_10NO}\mathrm{GSNO}^2\mathrm{O\_2m}$ $\mathrm{r\_4NO}-\mathrm{r\_6NO}-\mathrm{r\_7NO}-\mathrm{r\_8NO}-\mathrm{r\_9NO}-\mathrm{r\_18NO}$ $\mathrm{k\_6NO}\mathrm{ONOO\_m}\mathrm{GSH}$ $\mathrm{k\_7NO}\mathrm{ONOO\_m}\mathrm{GPX}$ $\mathrm{k\_8NO}\mathrm{ONOO\_m}\mathrm{CO\_2}$ $\mathrm{k\_9NO}\mathrm{ONOO\_m}\mathrm{Cyt\_c}$ 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